目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,研究GTP酶免疫相关蛋白8(GIMAP8)在肺腺癌中的表达及与预后的关系.方法 从TCGA数据库中下载肺腺癌组织的RNASeq数据以及临床数据,分析GIMAP8在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达差异;以GIMAP8表达水平的中位数(3.217)为界限将肺腺癌患者分为GIMAP8高表达组和GIMAP8低表达组,比较GIMAP8高表达组和GIMAP8低表达组患者的临床特征及生存情况,采用单因素及多因素Cox回归模型分析肺腺癌患者预后的影响因素.利用基因集富集分析(GSEA)软件分析GIMAP8在肺腺癌中可能的调控信号通路.结果 GIMAP8在肺腺癌组织中的表达水平明显低于正常肺组织,差异有统计学意义(P﹤0.01).不同年龄、性别、临床分期、T分期、M分期、N分期肺腺癌患者的肺腺癌组织中GIMAP8表达情况比较,差异均无统计学意义(P﹥0.05).多因素Cox回归分析结果显示,临床分期(HR=1.923,95％CI:1.209～3.057,P﹤0.01)为肺腺癌患者预后的独立影响因素.GIMAP8低表达肺腺癌患者中位总生存期明显短于GIMAP8高表达患者(P﹤0.01).GIMAP8基因低表达样本主要富集在氧化磷酸化、嘧啶代谢、RNA聚合酶、基底切除修复、蛋白酶体以及乙醛酸和二羧酸代谢等信号通路中.结论 GIMAP8在肺腺癌组织中低表达,与肺腺癌患者的预后有关,并通过参与多种信号通路促进肺腺癌的发生发展,可能是肺腺癌诊断和治疗的潜在生物标志物.

肺腺癌;TCGA数据库;GTP酶免疫相关蛋白8;预后

刘翼;吴强;张晓明;曾薇

深圳大学总医院胸心外科,广东 深圳 518055;新疆医科大学附属肿瘤医院胸外二科,乌鲁木齐 830011;南方医科大学南方医院肿瘤科,广州 5105150

癌症进展

[1]刘翼;吴强;张晓明;曾薇-.基于TCGA数据库研究GTP酶免疫相关蛋白8在肺腺癌中的表达及与预后的关系)[J].癌症进展,2022(15):1538-1541

GIMAP8,RNASeq

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