典型文献
基于免疫相关基因的子宫内膜癌预后模型构建
文献摘要：
目的 建立子宫内膜癌免疫相关基因预后模型,为子宫内膜癌免疫治疗提供参考.方法 从TCGA数据库下载子宫内膜癌转录组数据和临床信息,免疫相关基因列表从IMMPORT数据库获得.利用差异分析、功能富集分析评估差异免疫相关基因的功能,在训练队列中利用单因素、多因素Cox回归和最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)构建预后评估模型,利用时间依赖的受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、校准图、决策曲线(decision curve analysis,DCA)评估模型的效能.结果 本研究分析了504例子宫内膜癌组织和22例癌旁组织的免疫相关基因表达谱,获得394个差异表达基因,其中上调基因111个,下调基因283个;功能富集分析发现,差异基因主要参与免疫应答、信号转导和免疫反应等生物过程.在训练队列中通过单因素Cox回归分析确定了31个预后相关基因,通过LASSO?Cox回归建立了6个免疫基因(ANGPT4、HGF、PLA2G2A、SPAG11B、SST、VGF)的预测模型.该模型在训练队列中的1年、3年和5年ROC曲线下面积分别为0.986、0.846和0.849;在验证队列中分别为0.667、0.629和0.693;在整体队列中分别为0.798、0.735和0.770.结论 本研究基于6个免疫相关基因建立的预后模型可有效预测子宫内膜癌患者预后,为免疫治疗提供参考.
文献关键词：
子宫内膜癌;免疫相关基因;预后模型;TCGA
中图分类号：
作者姓名：
田济铭;邢义涓;胡玉萍;梁晓磊;杨永秀
作者机构：
730000 兰州 兰州大学第一临床医学院;兰州大学第一医院妇科;甘肃省妇科肿瘤重点实验室
文献出处：
引用格式：
[1]田济铭;邢义涓;胡玉萍;梁晓磊;杨永秀-.基于免疫相关基因的子宫内膜癌预后模型构建)[J].中国癌症防治杂志,2022(02):176-183
A类：
ANGPT4,PLA2G2A,SPAG11B
B类：
预后模型,免疫治疗,TCGA,下载,转录组数据,临床信息,列表,IMMPORT,功能富集分析,分析评估,评估差异,训练队,Cox,选择算法,least,absolute,shrinkage,selection,operator,LASSO,预后评估模型,时间依赖,受试者工作特征,receiver,operating,characteristic,决策曲线,decision,curve,analysis,DCA,例子,癌组织,癌旁组织,免疫相关基因表达,基因表达谱,差异表达基因,差异基因,免疫应答,信号转导,免疫反应,生物过程,预后相关基因,免疫基因,HGF,SST,VGF,子宫内膜癌患者
AB值：
0.301397
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