典型文献
菊花CmERA1基因的克隆与表达模式分析
文献摘要：
[目的]本文旨在克隆菊花ERA1(ENHANCED RESPONSE TO ABA)基因,并分析其表达模式,为探究其在调控菊花开花中的作用奠定基础.[方法]从夏菊品种'优香'的转录组数据库中筛选得到菊花中编码法尼基转移酶β亚基基因,并命名为CmERA1.提取野生型菊花'神马'叶片总RNA,以反转录后的cDNA为模板,对该基因cDNA全长进行克隆.运用生物信息学方法对其亲缘关系及其编码蛋白的特性进行分析预测;利用酵母单杂交系统对其转录激活活性进行分析;以绿色荧光蛋白GFP作为标签确定其亚细胞定位情况;利用实时荧光定量PCR对其在不同组织及不同光周期下的表达水平进行分析.[结果]CmERA1基因开放阅读框(ORF)全长1356 bp,编码451个氨基酸,相对分子质量为50.0×103,理论pI为5.12.系统进化分析显示其与青蒿中ERA1亲缘关系最近.蛋白质二级结构分析表明,CmERA1蛋白中α-螺旋含量最高.转录激活活性分析表明,CmERA1蛋白没有转录激活活性;亚细胞定位表明,CmERA1定位于细胞核中.CmERA1基因启动子分析表明,其含有分生组织表达元件、光响应元件、ABA和SA响应元件.荧光定量PCR结果表明,CmERA1在营养生长时期的叶片中表达最高,根中表达最低;在生殖生长时期的根中表达最高,舌状花中表达最低.CmERA1的表达能够响应光周期而呈节律性的变化.[结论]CmERA1基因的表达模式分析表明其响应光周期变化.
文献关键词：
菊花;基因克隆;CmERA1;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
李菲;户倩;翟怡雯;陈发棣;蒋甲福
作者机构：
南京农业大学园艺学院,江苏 南京210095
文献出处：
引用格式：
[1]李菲;户倩;翟怡雯;陈发棣;蒋甲福-.菊花CmERA1基因的克隆与表达模式分析)[J].南京农业大学学报,2022(02):254-260
A类：
CmERA1,ERA1,ENHANCED
B类：
菊花,克隆与表达,表达模式分析,RESPONSE,TO,ABA,花开花,转录组数据,选得,编码法,法尼基转移酶,亚基,野生型,神马,cDNA,全长,长进,生物信息学方法,亲缘关系,编码蛋白,分析预测,酵母单杂交,转录激活活性,绿色荧光蛋白,GFP,亚细胞定位,不同组织,光周期,开放阅读框,ORF,bp,相对分子质量,pI,系统进化分析,青蒿,蛋白质二级结构,活性分析,细胞核,基因启动子,启动子分析,分生组织,组织表达,光响应,响应元,SA,营养生长,生长时期,生殖生长,舌状花,够响,节律,周期变化,基因克隆
AB值：
0.329502
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