典型文献
感染GCRV的草鱼miRNA测序与比较分析
文献摘要:
为探索基于高通量筛选抗性主效miRNA功能分子的方法应用于抗性草鱼(Ctenopharyngodon idellus)的选育,研究借助高通量测序鉴定分析感染GCRV前后的草鱼头肾组织中miRNAs.测序结果共鉴定出821个成熟miRNAs,其中118个在GCRV攻毒组特异表达,82个为未攻毒组特有;差异分析结果显示,GCRV处理后有88个miRNA显著下调表达、46个miRNA显著上调表达;qPCR结果显示miR-21在GCRV感染组中的头肾中表达量最高,miR-194a在两个比较组中的差异倍数最大,达到48倍之高;组织表达结果发现部分差异表达miRNA在脾脏、肾脏、头肾、皮肤和鳃等免疫相关器官中高表达;这些结果提示不同的miRNAs在草鱼的GCRV应答过程中发挥着不同的功能,为抗病草鱼的选育提供可参考的分子资源.
文献关键词:
草鱼;高通量测序;miRNAs;差异表达;组织表达
中图分类号:
作者姓名:
肖调义;龙哲;李彬;张秋实;秦玲;熊舒婷
作者机构:
湖南农业大学动物科学技术学院,长沙 410128
文献出处:
引用格式:
[1]肖调义;龙哲;李彬;张秋实;秦玲;熊舒婷-.感染GCRV的草鱼miRNA测序与比较分析)[J].水生生物学报,2022(02):238-247
A类:
194a
B类:
GCRV,草鱼,高通量筛选,Ctenopharyngodon,idellus,选育,鉴定分析,鱼头,头肾,肾组织,miRNAs,攻毒,特异表达,qPCR,倍数,组织表达,差异表达,脾脏,免疫相关,相关器
AB值:
0.296792
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