[目的]鉴定筛选出与凡纳滨对虾(itopenaeus vannmei)性腺发育相关的miRNA及靶基因,为揭示其性腺分化的分子调控机制提供基础.[方法]通过高通量测序平台对凡纳滨对虾性腺进行miRNA测序分析.利用DESeq 2筛选出差异表达miRNA,并使用MiRanda对其进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能注释和KEGG富集分析;运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证4个显著差异表达miRNAs及6个候选靶基因的表达模式.[结果]分别从精巢和卵巢小RNA文库获得18～30 nt的高质量序列27665604和28431611条,其中精巢中鉴定出117个已知的成熟miRNAs和214个未知miRNAs;卵巢中鉴定出106个已知的成熟miRNAs和159个未知miRNAs.分析获得153个精巢和卵巢显著差异表达的miRNAs,共预测得到57412个差异表达miRNAs的靶基因.KEGG分析表明,这些靶基因显著富集的前20条KEGG通路包括白细胞介素-17信号通路、磷脂酶D信号通路、ECM-受体相互作用和Hedgehog信号通路等.RT-qPCR结果显示,miR-92b-3p_3、miR-263a-5p_1、novel_mir23及novel_mir67等miRNAs及其靶基因的表达模式与高通量测序结果基本一致,表明测序数据准确可靠.FoxL2、Dsx、NR1D1以及Octβ2R为精巢上调基因,在精巢中高表达;Vitellogenin为卵巢上调基因,在卵巢中特异性表达;而Huntingtin在精巢和卵巢中均高表达.[结论]miR-92b-3p_3和miR-263a-5p_1等4个差异表达miRNAs以及FoxL2、Dsx、NR1D1和Vitellogenin等6个靶基因与凡纳滨对虾性腺发育密切相关,共同调节性腺的成熟过程.

凡纳滨对虾;性腺;miRNA;靶基因;RT-qPCR

许尤厚;李鑫;彭金霞;李蔚;张兴志;官俊良;何庆松;陈泳先;张立;张彬;韦嫔媛;何苹萍

北部湾大学海洋学院,广西 钦州 535011;广西水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021

广东海洋大学学报

[1]许尤厚;李鑫;彭金霞;李蔚;张兴志;官俊良;何庆松;陈泳先;张立;张彬;韦嫔媛;何苹萍-.凡纳滨对虾性腺差异表达miRNA分析鉴定及靶基因验证)[J].广东海洋大学学报,2022(06):47-55

itopenaeus,vannmei,MiRanda,263a,mir23,mir67,FoxL2,Dsx,Huntingtin

凡纳滨对虾,差异表达,分析鉴定,性腺发育,性腺分化,分子调控机制,高通量测序平台,测序分析,DESeq,出差,靶基因预测,对靶,功能注释,富集分析,qPCR,miRNAs,表达模式,精巢,文库,巢中,磷脂酶,ECM,Hedgehog,92b,3p,5p,novel,序数,NR1D1,Oct,2R,Vitellogenin,特异性表达,同调,调节性,成熟过程

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