典型文献
大麦NRAMP全基因组鉴定及重金属胁迫下基因表达分析
文献摘要:
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage protein,NRAMP)是植物中一类重要的膜转运蛋白,在转运和重新利用重金属离子中起着重要作用.研究Mn2+、Cd2+、Cu2+三种重金属离子与NRAMP家族基因表达调控之间的作用机制,为进一步明确NRAMP家族基因对大麦抗重金属胁迫的作用提供依据.利用生物信息学的方法从大麦(Hordeum vulgare L.)全基因组中筛选鉴定NRAMP家族基因序列,对该家族成员进行基因结构、保守基序、进化特征及表达谱分析,并利用qRT-PCR的方法检测不同重金属离子胁迫下大麦幼苗中NRAMP基因的表达情况.结果表明,从大麦基因组中共鉴定出10个NRAMP家族成员,且主要定位在细胞膜上;进化分析表明,亲缘关系近的家族成员保守基序、基因结构都更为相似,且大麦与水稻的NRAMP家族成员间亲缘关系更接近;定量检测结果显示,在Mn2+胁迫下,HvNramp1、HvNramp2表达水平显著上调;在Cd2+胁迫下,除HvNramp8表达量显著下调外,其余基因均上调;在Cu2+胁迫下,除HvNramp3外其余6个基因的表达量均显著上调.大麦NRAMP家族基因能够通过正向调控响应重金属离子的胁迫.
文献关键词:
大麦;NRAMP基因家族;重金属胁迫;生理指标;基因表达
中图分类号:
作者姓名:
李一涵;于浪柳;李春燕;张蒙蒙;张晓勤;方云霞;薛大伟
作者机构:
杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州 311121
文献出处:
引用格式:
[1]李一涵;于浪柳;李春燕;张蒙蒙;张晓勤;方云霞;薛大伟-.大麦NRAMP全基因组鉴定及重金属胁迫下基因表达分析)[J].生物技术通报,2022(06):103-111
A类:
HvNramp1,HvNramp2,HvNramp8,HvNramp3
B类:
NRAMP,全基因组鉴定,重金属胁迫,基因表达分析,巨噬细胞,natural,resistance,associated,macrophage,protein,转运蛋白,新利,重金属离子,Mn2+,Cd2+,Cu2+,家族基因,基因表达调控,抗重金属,利用生物,Hordeum,vulgare,筛选鉴定,基因序列,基因结构,保守基序,进化特征,表达谱分析,qRT,金属离子胁迫,大麦幼苗,细胞膜,进化分析,亲缘关系,水稻,定量检测,基因家族,生理指标
AB值:
0.274561
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