典型文献
栽培草莓潜在印记基因FaTRG-31的克隆与特征分析
文献摘要：
在前期通过筛选获得草莓候选印记基因FaTRG-31(turgor-responsive protein 31)的基础上,以八倍体栽培草莓'红颜'(Fragaria×ananassa Duch.'Benihoppe')为材料,对FaTRG-31基因的编码序列进行克隆、生物信息学、组织表达、启动子和印记特性分析,以揭示该基因的作用机理,为草莓印记基因表达调控及生物学功能研究奠定基础.结果显示:(1)草莓FaTRG-31基因开放阅读框(ORF)全长999 bp,编码332个氨基酸,含有典型的Asn-Pro-Ala(NPA)基序和6个跨膜结构,定位于细胞质膜,属于典型的AQP蛋白(aquaporin)家族;系统进化树深入分析表明FaTRG-31为PIPs(plasma intrinsic proteins)亚家族1型蛋白.(2)草莓FaTRG-31在不同组织中均有表达,胚乳中的表达量最高,且在FaTRG-31基因上游克隆出的1989 bp启动子序列中发现含有与胚乳特异表达相关的作用元件,此外还有多种非生物胁迫响应元件和激素响应元件等.(3)草莓印记特性分析结果显示,FaTRG-31在胚乳中的SNP(single nucleotide polymorphism)位点处测序峰为单峰且是母本表达,即该基因在栽培草莓胚乳中为母本表达印记基因.(4)非生物胁迫处理后分析发现,草莓FaTRG-31基因能在不同程度上响应非生物胁迫.
文献关键词：
草莓;FaTRG-31;表达分析;印记基因
中图分类号：
作者姓名：
安琪;张红;怀欣佳;荆晓彤;熊劲松;乔玉山
作者机构：
南京农业大学园艺学院,南京 210095
文献出处：
引用格式：
[1]安琪;张红;怀欣佳;荆晓彤;熊劲松;乔玉山-.栽培草莓潜在印记基因FaTRG-31的克隆与特征分析)[J].西北植物学报,2022(07):1103-1112
A类：
FaTRG
B类：
草莓,印记基因,过筛,turgor,responsive,八倍,红颜,Fragaria,ananassa,Duch,Benihoppe,编码序列,组织表达,基因表达调控,生物学功能,功能研究,开放阅读框,ORF,全长,bp,Asn,Pro,Ala,NPA,基序,膜结构,细胞质,质膜,AQP,aquaporin,系统进化树,PIPs,plasma,intrinsic,proteins,亚家族,不同组织,胚乳,启动子序列,特异表达,胁迫响应,响应元,激素响应,SNP,single,nucleotide,polymorphism,单峰,母本,本表,非生物胁迫处理,表达分析
AB值：
0.387902
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