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典型文献
铁皮石斛DcbHLH14基因克隆及表达分析
文献摘要:
[目的]克隆铁皮石斛转录因子DcbHLH14基因并分析其在非生物胁迫响应中的表达情况,为研究DcbHLH14基因的功能提供理论参考.[方法]通过同源克隆从铁皮石斛叶组织中得到DcbHLH14基因,对其编码的蛋白序列特征和组织表达特性进行分析,并采用qRT-PCR对DcbHLH14基因在低温、干旱和ABA处理过程中的表达量进行分析.[结果]DcbHLH14基因开放阅读框(Open reading frame,ORF)为1269 bp,与参考序列存在7个碱基差异,仅含有1个外显子且无内含子,编码422个氨基酸.DcbHLH14蛋白的分子式为C2011H3192N586O613S13,理论分子量为45.8 kD,理论等电点(pI)为5.98,含有bHLH家族保守结构域bHLH-MYC-N和HLH,属于bHLH家族,与鼓槌石斛(Dendrobium chrysotoxum)和春兰(Cymbidium goeringii)bHLH蛋白的氨基酸序列同源性较高,分别为97.16%和86.90%.转录组分析结果显示,DcbHLH14基因在云南产地野生铁皮石斛花蕾中的表达量最高,在叶中的表达量最低.进一步qRT-PCR分析结果表明,该基因在广东丹霞铁皮石斛叶中的表达量最高,而在茎中的表达量最低.DcbHLH14基因启动子富含多种与水分胁迫、低温、脱水以及ABA响应等相关的顺式作用元件.DcbHLH14基因明显受到低温、干旱和ABA诱导,低温和ABA处理6 h后DcbHLH14表达量被显著提高并达到峰值,分别是处理前的12.6倍和3.7倍;干旱处理9 h后,DcbHLH14表达量最高,是处理前的6.5倍,达到极显著差异水平.[结论]DcbHLH14基因可能在转录水平上通过依赖于ABA信号通路途径响应低温和干旱胁迫,从而调控下游功能基因表达,提高铁皮石斛抗逆性.
文献关键词:
铁皮石斛;DcbHLH14基因;非生物胁迫;表达分析
作者姓名:
理雅;刘博婷;赖思慧;罗伟红;于白音;刘羽佳
作者机构:
广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室/韶关学院,广东 韶关 512005;河南农业大学农学院,河南 郑州 450046
文献出处:
引用格式:
[1]理雅;刘博婷;赖思慧;罗伟红;于白音;刘羽佳-.铁皮石斛DcbHLH14基因克隆及表达分析)[J].福建农业学报,2022(09):1145-1155
A类:
DcbHLH14,C2011H3192N586O613S13,chrysotoxum,丹霞铁皮石斛
B类:
基因克隆,表达分析,非生物胁迫,胁迫响应,同源克隆,铁皮石斛叶,序列特征,组织表达特性,qRT,ABA,开放阅读框,Open,reading,frame,ORF,bp,参考序列,碱基,基差,外显子,内含子,分子式,分子量,kD,等电点,pI,保守结构域,MYC,鼓槌石斛,Dendrobium,春兰,Cymbidium,goeringii,氨基酸序列,序列同源性,转录组分析,生铁皮,铁皮石斛花,花蕾,东丹,基因启动子,水分胁迫,顺式作用元件,因明,旱处理,转录水平,路途,低温和干旱胁迫,功能基因,抗逆性
AB值:
0.29643
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