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基于GSEA分析FoxM1表达变化对人肝内胆管细胞癌增殖及侵袭相关信号通路的影响
文献摘要：
目的 通过比较分析FoxM1表达高低对肝内胆管细胞癌(ICC)中增殖及侵袭相关细胞信号通路的影响,进而部分揭示其发生发展分子机制.方法 从TCGA数据库下载36例ICC患者的mRNA数据,按照总体叉头盒蛋白M1(FoxM1)表达值中位数将其分为FoxM1高表达组、FoxM1低表达组,使用基因集富集分析(GSEA)软件进行生物信息学分析寻找FoxM1高低表达组之间可能存在的差异表达基因及影响的相关信号通路.采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)比较ICC细胞系中FoxM1及P53 mRNA的表达关系.结果 GSEA分析表明,ICC中FoxM1高表达组中常见基因信号通路如P53、MYC信号通路表达差异均有统计学意义,而FoxM1低表达组中FOXO等信号通路表达差异有统计学意义(均FDR-q值＜0.250).RT-PCR结果显示,慢病毒转染后上调FoxM1表达的HCCC-9810-FoxM1细胞组中P53 mRNA表达较对照组升高,而下调FoxM1表达的SSP-25-shFoxM1细胞组中P53 mRNA水平较对照组则下降,差异均有统计学意义(P＜0.000 1).结论 FoxM1可能在ICC发生发展等不同演进阶段产生广泛作用.FoxM1表达可能与P53相关,ICC中FoxM1可能影响P53信号通路.
文献关键词：
叉头盒蛋白M1;肝内胆管细胞癌;增殖;信号通路;计算生物学;P53
中图分类号：
作者姓名：
刘凌云;毛涵;黄培露;陈书乐
作者机构：
桂林医学院附属医院肝胆胰外科,广西桂林 541001
文献出处：
引用格式：
[1]刘凌云;毛涵;黄培露;陈书乐-.基于GSEA分析FoxM1表达变化对人肝内胆管细胞癌增殖及侵袭相关信号通路的影响)[J].中国医药导报,2022(29):21-24,33
A类：
shFoxM1
B类：
GSEA,表达变化,肝内胆管细胞癌,ICC,细胞信号通路,TCGA,下载,叉头盒,中位数,低表达,基因集富集分析,生物信息学分析,差异表达基因,细胞系,P53,表达关系,基因信号通路,MYC,信号通路表达,表达差异,FOXO,FDR,慢病毒转染,HCCC,SSP,演进阶段,计算生物学
AB值：
0.197423
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