典型文献
基于数据挖掘的PFKFB4在宫颈癌中的表达和基因调控网络研究
文献摘要：
目的 研究6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4(PFKFB4)的表达水平与宫颈癌患者临床病理特征和预后的关系,并探讨PFKFB4在宫颈癌进展中的调控网络.方法 利用Linked Omics数据平台分析PFKFB4的表达与宫颈癌患者临床病理特征及预后的关系.利用Linked Omics的Link Finder模块Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)对差异相关基因进行基因本体(GO)[细胞成分(CC),生物过程(BP)和分子功能(MF)]分析.KEGG信号通路分析激酶靶标富集,miRNA靶标富集和转录因子靶标富集.cBioPortal用于分析PFKFB4在宫颈癌中的变异频率和类型.Gene MANIA用于分析与PFKFB4存在相互作用的基因以及主要涉及的功能.结果 PFKFB4与宫颈癌的T分期、N分期和M分期显著相关;T分期越高、有淋巴结转移(N1)、伴有远处转移(M1)者PFKFB4表达量越高;PFKFB4高表达患者的总生存显著差于低表达患者(P=0.002);GO分析提示PFKFB4相关基因与蛋白结合、离子结合、核酸结合、水解酶活动、转移酶活动等相关;KEGG信号通路富集分析则发现,PFKFB4及相关基因在宫颈癌中主要参与了缺氧诱导因子HIF1信号通路、糖酵解/糖再生信号通路、果糖和甘露糖代谢通路等;GSEA分析显示,MK2PK1、CHEK1、miR-200a、miR-18a、HIF1、AP1与PFKFB4的表达显著相关;cBioPortal分析显示,PFKFB4在宫颈癌中主要变异形式为mRNA高表达,但是突变频率较低.结论 PFKFB4是宫颈癌一个潜在的预后标记物.通过数据挖掘揭示了PFKFB4的潜在调控网络信息,为进一步研究PFKFB4在宫颈癌中的作用奠定基础.
文献关键词：
6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2;6-二磷酸酶4;宫颈癌;生物信息学;诊断;预后
中图分类号：
作者姓名：
古彩茹;刘威;林梦园
作者机构：
广州市红十字会医院&暨南大学附属广州红十字会医院妇科,广东 广州 510220;广州市红十字会医院&暨南大学附属广州红十字会医院乳腺科,广东 广州 510220;深圳市人民医院妇科,广东 深圳 518020
文献出处：
引用格式：
[1]古彩茹;刘威;林梦园-.基于数据挖掘的PFKFB4在宫颈癌中的表达和基因调控网络研究)[J].海南医学,2022(02):137-142
A类：
MK2PK1
B类：
PFKFB4,基因调控网络,果糖,二磷酸,宫颈癌患者,临床病理特征,Linked,Omics,Finder,Gene,Set,Enrichment,Analysis,GSEA,异相,基因本体,细胞成分,CC,生物过程,MF,通路分析,靶标,miRNA,cBioPortal,异频,MANIA,淋巴结转移,N1,远处转移,M1,总生存,低表达,蛋白结合,离子结合,水解酶,转移酶,信号通路富集,通路富集分析,缺氧诱导因子,HIF1,糖酵解,生信,甘露糖,糖代谢,代谢通路,CHEK1,200a,18a,AP1,异形,突变频率,预后标记物
AB值：
0.303542
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