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典型文献
基于疾病基因表达谱和药物转录组的抗高尿酸血症药物"重定位"
文献摘要:
目的 采用疾病基因表达谱和药物转录组相结合的老药新用策略,从老药中筛选具有抗高尿酸血症的药物.方法 通过高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)转录组数据库筛选HUA差异表达基因,使用DAVID数据库与STRING平台对差异基因进行筛选与分析.通过Connectivity Map数据库从候选药物中筛选预测抗HUA药物,选择富集分数较高的药物与差异表达核心靶点,利用SwissDock平台进行分子对接.CCK-8法检测候选抗HUA药物对HK-2细胞活力的影响,验证候选药物对HUA细胞模型的黄嘌呤氧化酶活性和尿酸浓度的影响.结果 在HUA转录组数据库中,获得1492个差异基因,其中下调基因810个,上调基因682个,差异基因涉及HDASC deacetylate histones、IL-7、UB-specific processing proteases等通路;通过Connectivity Map数据库预测15个药物具有抗HUA潜力,分子对接表明阿维菌素与核心靶点IL-1β、TNF、CXCL2和IL-6的结合能分别为-7.68、-7.97、-6.25、-6.73 kcal/mol;细胞实验表明,12.5~100μg/mL药物浓度范围内阿维菌素具有良好的细胞安全性、抑制黄嘌呤氧化酶活性和降低尿酸作用(P<0.05).结论 通过疾病基因表达谱和药物转录组数据相结合策略发现阿维菌素具有抗高尿酸潜力.
文献关键词:
阿维菌素;疾病基因表达谱;药物转录组;高尿酸血症;分子对接
作者姓名:
逄成章;刘文彬;金小宝
作者机构:
广东药科大学生命科学与生物制药学院 广州510006;广东省生物活性药物研究重点实验室 广州511436
文献出处:
引用格式:
[1]逄成章;刘文彬;金小宝-.基于疾病基因表达谱和药物转录组的抗高尿酸血症药物"重定位")[J].实用医学杂志,2022(22):2838-2844
A类:
疾病基因表达谱,药物转录组,HDASC,deacetylate
B类:
高尿酸血症,重定位,新用,hyperuricemia,HUA,转录组数据,差异表达基因,DAVID,STRING,差异基因,Connectivity,Map,候选药物,核心靶点,SwissDock,分子对接,CCK,测候,HK,细胞活力,证候,细胞模型,黄嘌呤氧化酶,氧化酶活性,酸浓度,histones,UB,specific,processing,proteases,阿维菌素,CXCL2,结合能,kcal,细胞实验,药物浓度,制黄,结合策略
AB值:
0.256914
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