典型文献
奶牛乳脂代谢关键miRNAs的筛选及鉴定
文献摘要：
旨在探究影响中国荷斯坦奶牛乳脂代谢过程的关键miRNAs及靶mRNAs.本研究选择泌乳中后期(150～220 d)的第一胎次且乳脂率具有极端差异的8头宁夏荷斯坦奶牛,根据乳脂率的差异分为两组:高乳脂组和低乳脂组,每组4个重复.采集8头奶牛的奶样分离乳腺上皮细胞,进行转录组测序和生物信息学分析,筛选出差异表达miRNA-mRNA并与乳脂率进行相关性分析.通过实时荧光定量PCR验证miRNAs和mRNAs表达.结果表明,8个small RNA(sRNA)文库测序获得11 976 914～16 235 680的clean reads,占总raw reads的比例均在97％以上,Q30达到91％以上,sRNA片段长度主要分布在21～24 nt.在高乳脂组和低乳脂组间共鉴定了 34个差异表达miRNAs(16个上调,18个下调).GO和KEGG富集分析表明,差异表达miRNAs的靶基因在细胞内信号转导、单一生物体过程、激酶结合和磷酸转移酶活性等功能条目显著富集,并且显著富集到TNF信号传导途径、MAPK信号传导途径、Ras信号传导途径、Rap1信号通路和催产素信号传导途径等乳脂代谢相关通路.通过miRNA-mRNA综合分析,共获得16个miRNA—靶基因对,其中miR-1343-3p和MTM1与乳脂率显著负相关,miR-370、miR-2285cb和SRRM2与乳脂率显著正相关.RT-qPCR验证差异表达miRNA和mRNA与转录组测序表达趋势一致.这些结果从miRNA和mRNA水平探究了宁夏地区荷斯坦奶牛乳脂代谢的功能机制,鉴定出miR-370-MTM1、miR-1343-3p-DIS3L2、miR-2285cb-XLOC-122799和miR-2387-SRRM2互作对可能是调控奶牛乳脂代谢的关键因子.
文献关键词：
miRNA;乳脂;中国荷斯坦奶牛;转录组学;miRNA-mRNA互作
中图分类号：
作者姓名：
刘佳敏;禹保军;母童;张迪;冯小芳;张娟;王影;温万;顾亚玲
作者机构：
宁夏大学农学院,银川750021;宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室,银川750021;宁夏畜牧工作站,银川750002
文献出处：
引用格式：
[1]刘佳敏;禹保军;母童;张迪;冯小芳;张娟;王影;温万;顾亚玲-.奶牛乳脂代谢关键miRNAs的筛选及鉴定)[J].畜牧兽医学报,2022(12):4244-4257
A类：
乳脂代谢,MTM1,2285cb,SRRM2
B类：
牛乳,miRNAs,探究影响,中国荷斯坦奶牛,代谢过程,mRNAs,泌乳,第一胎,胎次,乳脂率,端差,乳腺上皮细胞,转录组测序,生物信息学分析,出差,差异表达,small,sRNA,文库,clean,reads,raw,Q30,段长度,nt,富集分析,靶基因,细胞内信号,信号转导,生物体,转移酶,条目,信号传导,传导途径,MAPK,Ras,Rap1,催产素,相关通路,共获,3p,qPCR,宁夏地区,功能机制,DIS3L2,XLOC,关键因子,转录组学
AB值：
0.255955
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