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典型文献
苏尼特羊Lnc_000588的组织表达及其在调控肌肉生长发育中互作分子的预测
文献摘要:
苏尼特羊(Ovis aries)是我国优质的肉羊资源,也是我国北方地区主要羊肉来源之一.长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)在绵羊肌肉发育中发挥重要作用.为预测Lnc_000588在苏尼特羊骨骼肌发育中的调控网络,本研究对其在不同部位的组织表达量进行了实时荧光定量PCR分析及靶向miRNA-mRNA的生物信息学互作预测.同时,在小鼠(Mus musculus)成肌纤维细胞(C2C12)中检测了Lnc_000588的表达量.Lnc_000588在各组织中均有表达,且在背最长肌中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01);Lnc_000588在C2C12细胞中的表达量随着细胞分化时间的延长而增加,48 h以后极显著高于较早时的表达(P<0.01).;Lnc_000588可能通过miRNA参与调控肌肉的生长发育,其中的3个miRNA的靶基因富集于Ras信号通路(oas04014:Ras signaling pathway)、Rap1信号通路(oas04015:Rap1 signaling pathway)和AMPK信号通路(oas04152:AMPK signaling pathway)等66条通路.综上,Lnc_000588在苏尼特羊肌肉组织的表达量极显著高于其他组织,推测其参与了C2C12细胞分化.本研究为探究LncRNA参与苏尼特羊肌肉组织的调控功能提供了科学依据.
文献关键词:
长链非编码RNA(LncRNA);苏尼特羊;肌肉;靶基因
作者姓名:
宫文典;王瑞雪;王荣;刘俊阳;穆卿;特日格勒;吴子贤;李蕴华;刘佳森;赵艳红
作者机构:
内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室/农业农村部肉羊遗传育种重点实验室,呼和浩特010018;内蒙古自治区农牧业科学院畜牧研究所,呼和浩特010031
引用格式:
[1]宫文典;王瑞雪;王荣;刘俊阳;穆卿;特日格勒;吴子贤;李蕴华;刘佳森;赵艳红-.苏尼特羊Lnc_000588的组织表达及其在调控肌肉生长发育中互作分子的预测)[J].农业生物技术学报,2022(12):2333-2343
A类:
oas04014,oas04015,oas04152
B类:
苏尼特羊,组织表达,肌肉生长发育,Ovis,aries,肉羊,北方地区,羊肉,长链非编码,long,coding,LncRNA,绵羊,肌肉发育,羊骨,骨骼肌,调控网络,不同部位,miRNA,Mus,musculus,肌纤维细胞,C2C12,背最长肌,他组织,细胞分化,分化时间,靶基因,基因富集,Ras,signaling,pathway,Rap1,AMPK,肌肉组织,调控功能
AB值:
0.29575
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