典型文献
共轭亚油酸影响边鸡胸肌脂类代谢的相关差异基因的筛选
文献摘要：
旨在通过转录组测序技术筛选出共轭亚油酸(conjugated linoleic acids,CLA)影响边鸡胸肌脂类代谢的相关基因,为日粮中CLA调控边鸡脂类代谢的作用机制提供理论依据.本试验选取90日龄健康边鸡180只,随机分为5组,每组3个重复,每组日粮中分别添加不同比例的CLA 0％(对照组)、0.5％、1.0％、1.5％和2.0％,预饲期1周,正饲期6周.饲养试验结束后采集胸肌组织进行转录组测序,使用DESeq2软件对测序数据进行差异表达分析,对差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,筛选出与胸肌脂类代谢相关的差异表达基因,利用qPCR对差异表达基因进行验证.通过转录组测序数据分析,共筛选出1 229个差异表达基因,其中594个基因上调,635个基因下调.随机选取9个差异表达基因进行qPCR验证,其相对表达量变化趋势与测序结果一致.GO功能分析发现,差异表达基因主要集中在生物学过程中的细胞过程、单一生物过程、生物调节和代谢过程.KEGG通路富集分析发现,各试验组中差异表达基因显著富集在不同的信号通路中,主要富集在ECM-受体相互作用、黏着斑、吞噬体、细胞凋亡、肌动蛋白细胞骨架调节和细胞因子-细胞因子受体相互作用等通路中.通过GO和KEGG功能注释分析,共筛选出 MCA T、A POA1、PTGDS、ALDH3A2、PLTP、FABP3、FOXO1、UCP3和 FABP4 等 18个主要的参与脂类代谢相关的差异表达基因,可能在调控边鸡胸肌脂类代谢中发挥重要的作用.本研究通过转录组测序筛选出CLA影响边鸡胸肌脂类代谢过程中的主要调控基因,发现了日粮中CLA影响差异表达基因作用的主要生物学过程和信号通路,为今后研究CLA影响边鸡胸肌脂类代谢的分子作用机制奠定了基础.
文献关键词：
边鸡;共轭亚油酸;转录组;脂类代谢
中图分类号：
作者姓名：
张俊珍;张蒙;李亚莉;常强强;孙天原
作者机构：
山西农业大学动物科学学院,太谷030801;山西省养殖技术试验基地,太原030000
文献出处：
引用格式：
[1]张俊珍;张蒙;李亚莉;常强强;孙天原-.共轭亚油酸影响边鸡胸肌脂类代谢的相关差异基因的筛选)[J].畜牧兽医学报,2022(05):1486-1499
A类：
边鸡,POA1
B类：
共轭亚油酸,鸡胸,胸肌,脂类代谢,差异基因,转录组测序技术,技术筛选,conjugated,linoleic,acids,CLA,日粮,鸡脂,日龄,饲养试验,肌组织,DESeq2,序数,差异表达分析,差异表达基因,通路富集分析,qPCR,相对表达量,功能分析,生物学过程,生物过程,代谢过程,各试,ECM,黏着斑,吞噬体,肌动蛋白,细胞骨架,细胞因子受体,功能注释,MCA,PTGDS,ALDH3A2,PLTP,FABP3,FOXO1,UCP3,FABP4,调控基因,影响差异,分子作用机制
AB值：
0.257873
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