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典型文献
基于生物信息学分析鉴定子宫内膜异位症关键枢纽基因和信号通路
文献摘要:
目的 基于生物信息学技术,分析子宫内膜异位症的在位内膜与正常人群子宫内膜的差异,寻找参与子宫内膜异位症发病的关键致病基因及其信号通路.方法 从GEO数据库中挖掘子宫内膜异位症与正常人群的差异表达基因,构建蛋白互作网络图与模块分析,筛选出功能富集度最高的一个核心模块,对核心模块基因进行KEGG通路富集分析.结果 在GEO数据库获得3个数据集GSE6364,GSE7305,GSE25628,鉴定出279个共同的差异表达基因,其中171个上调,108个下调.通过蛋白互作网络筛选关联性较强的枢纽基因,通过模块分析获得了最显著的模块,包括10个枢纽基因;KEGG通路分析显示,枢纽基因主要富集于剪接体,mRNA监测,癌症通路中的转录调控失调和蛋白聚糖.结论 子宫内膜异位症是一种复杂的多因素疾病,通过生物信息学分析,鉴定了子宫内膜异位症发病的关键枢纽基因和信号通路,为子宫内膜异位症发病机制提供新思路,为后续深入研究和潜在的治疗靶点筛选提供了基础.
文献关键词:
子宫内膜异位症;生物信息学;关键枢纽基因
作者姓名:
刘玉娟;郭思璇;刘珈宸;万佳;吴春玲
作者机构:
南昌市第一医院,南昌 330006;南昌大学医学院,南昌 330031;景德镇市妇幼保健院妇产科,景德镇 333099
文献出处:
引用格式:
[1]刘玉娟;郭思璇;刘珈宸;万佳;吴春玲-.基于生物信息学分析鉴定子宫内膜异位症关键枢纽基因和信号通路)[J].江西医药,2022(01):10-13,36
A类:
GSE6364,GSE25628
B类:
生物信息学分析,分析鉴定,定子,子宫内膜异位症,关键枢纽基因,生物信息学技术,在位,正常人,致病基因,GEO,差异表达基因,蛋白互作网络,网络图,功能富集,富集度,一个核心,核心模块,通路富集分析,GSE7305,选关,通路分析,剪接体,癌症通路,转录调控,控失,蛋白聚糖,治疗靶点,靶点筛选
AB值:
0.190753
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