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人乌头酸脱羧酶1基因及其编码蛋白的生物信息学分析
文献摘要：
目的 对人乌头酸脱羧酶1(aconitate decarboxylase 1,ACOD1)基因的转录调控因素及其编码蛋白的分子功能进行分析.方法 采用多种生物信息学软件对人ACODl基因启动子区域转录因子结合位点、甲基化CpG位点、单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism,SNP)位点进行预测,对人ACOD1基因编码的蛋白进行GO(Gene Onotology)蛋白功能注释分析及蛋白互作网络分析.结果 人ACOD1基因启动子区域存在3个启动子序列,17个转录因子结合位点,无甲基化CpG位点,并存在12个SNP位点;人ACOD1蛋白具有多种分子功能并参与多种生物过程,可能与白细胞介素-1β(interleukin-1 beta,IL-iβ)、C-C 基序趋化因子-4(C-C motif chemokine-4,CCL-4)、干扰素调节因子 1(interferon regulatory factor 1,IRF1)和 C-X-C 基序趋化因子 10(C-X-C motif chemokine 10,CXCL10)等蛋白具有相互作用关系.结论 本文为进一步研究人ACOD1基因和蛋白的表达调控机制及生物功能提供参考,并有助于研究其在炎症反应、病原体感染等复杂疾病中的调控机制.
文献关键词：
ACOD1基因;启动子;ACOD1蛋白;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
汪涛;孙新;蒋佩佳;肖锦仁;李玲
作者机构：
湖南中医药大学药学院,湖南长沙410208;湖南省中药现代化实验室,湖南长沙410208
文献出处：
引用格式：
[1]汪涛;孙新;蒋佩佳;肖锦仁;李玲-.人乌头酸脱羧酶1基因及其编码蛋白的生物信息学分析)[J].中国生物制品学杂志,2022(10):1178-1183
A类：
ACOD1,ACODl,singlenucleotide,Onotology
B类：
乌头,脱羧酶,编码蛋白,生物信息学分析,aconitate,decarboxylase,转录调控,调控因素,生物信息学软件,基因启动子区,启动子区域,转录因子结合位点,甲基化,CpG,单核苷酸多态性,polymorphism,SNP,基因编码,Gene,蛋白功能,功能注释,蛋白互作网络分析,启动子序列,生物过程,interleukin,beta,基序,趋化因子,motif,chemokine,CCL,干扰素调节因子,interferon,regulatory,IRF1,CXCL10,相互作用关系,表达调控,调控机制,生物功能,病原体感染
AB值：
0.317333
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