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典型文献
-株产酶真菌Phaeophlebiopsis sp.转录组分析
文献摘要:
对从药渣中分离的真菌ZYJHYZ254进行鉴定及产酶活性研究,从转录组分析菌株不同生长时期差异表达基因对其生长发育及产酶调控的影响,以筛选高产木质纤维素水解酶真菌,寻找调控关键基因.鉴定ZYJHYZ254为拟暗射脉菌Phaeophlebiopsis sp.,产酶在第5-7天最高.从生长3 d与7 d的菌丝中共检测到1 232个差异基因,以3 d的菌丝为对照,显著上调、下调基因分别有826及406个,基因注释和GO、KEGG功能富集分析结果表明差异表达基因主要与蛋白质合成、代谢及酶合成相关.此外,共有387个CAZymes基因表达,GH数量最多,约占49.61%,其次为AA(97)与GT(62),约占25.06%与16.02%.GH16(24个)占GH的12.50%,含量最多,主要编码葡萄糖苷酶、木聚糖酶等,AA中AA3(37个)占比38.14%,编码氧化酶、脱氢酶等.结果表明ZYJHYZ254中生长3 d与7 d的菌丝经功能富集分析发现差异表达基因主要与蛋白质合成、代谢,以及酶合成相关.进一步研究发现在两个生长时期中CAZymes基因表达最多的是GH16与AA3,预示了该菌葡萄糖苷酶、木聚糖酶、β-半乳糖苷酶、氧化酶与脱氢酶含量最丰富,对降解特殊生物质中的木质纤维素具有重要意义.
文献关键词:
特殊环境;丝状真菌;转录组学;木质纤维素;碳水化合物活性酶
作者姓名:
程敏;郭鑫瑶;李启瑞;王迪;李小兵;康颖倩
作者机构:
贵州医科大学基础医学院微生物学教研室,贵州贵阳550025;贵州省微生物与人类健康关系研究人才基地贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室,贵州贵阳550025;贵州医科大学环境污染与疾病监控教育部重点实验室,贵州贵阳550025;贵州省赤水河畔酱酒研究中心,贵州贵阳550003;贵州省烟草科学研究院,贵州贵阳550009
文献出处:
引用格式:
[1]程敏;郭鑫瑶;李启瑞;王迪;李小兵;康颖倩-.-株产酶真菌Phaeophlebiopsis sp.转录组分析)[J].菌物学报,2022(10):1634-1646
A类:
Phaeophlebiopsis,ZYJHYZ254,特殊生物质
B类:
株产,sp,转录组分析,药渣,产酶活性,活性研究,生长时期,差异表达基因,木质纤维素,纤维素水解,水解酶,关键基因,菌丝,差异基因,基因注释,功能富集分析,蛋白质合成,CAZymes,GT,GH16,葡萄糖苷酶,木聚糖酶,AA3,预示,半乳糖,酶含量,特殊环境,丝状真菌,转录组学,碳水化合物活性酶
AB值:
0.238196
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