典型文献
高原雨点鸽与詹森鸽胸肌转录组差异表达基因筛选与功能分析
文献摘要:
筛选高原雨点鸽与詹森鸽胸肌飞行能力差异的关键基因,为赛鸽选育奠定基础.选择性别相同、体况与日龄相近的高原雨点鸽、詹森鸽各3只,屠宰后取胸肌,进行转录组测序,筛选差异表达基因,对差异基因进行Gene Ontology(GO)分析、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)分析与蛋白质互作网络分析.结果表明:高原雨点鸽与詹森鸽胸肌转录组比较共检测到75个显著差异基因,49个基因上调表达,26个基因下调表达;GO功能分析显示,差异基因主要富集在骨骼肌细胞分化、细胞代谢过程调节等条目;KEGG通路分析显示,差异基因显著富集在胰岛素信号通路、AMPK信号通路等.与詹森鸽相比,高原雨点鸽胸肌SMYD1、STAT1、VEGFA、PPM1K、PLCE1基因上调,MYOD1、SOCS3、MGLL基因下调.STAT1、MYOD1可能导致高原雨点鸽胸肌生长慢于詹森鸽;SOCS3可能导致高原雨点鸽胸肌肌纤维直径变小,爆发力下降;PLCE1可能导致高原雨点鸽胸肌肌纤维增多;SMYD1可能导致肌纤维分化形成更多的红肌纤维;VEGFA可能导致高原雨点鸽体内白色脂肪转化为棕色脂肪;PPM1K、MGLL可能催化支链氨基酸分解,为高原雨点鸽长距离负重飞行提供足够能量,更适宜远距离飞行.
文献关键词:
高原雨点鸽;詹森鸽;转录组;差异表达基因;胸肌
中图分类号:
作者姓名:
兰国湘;金思琪;李星润;刘喜雨;李国美;董新星
作者机构:
云南农业大学 动物科学技术学院,云南 昆明650201;大理农林职业技术学院 动物科学学院,云南 大理671003
文献出处:
引用格式:
[1]兰国湘;金思琪;李星润;刘喜雨;李国美;董新星-.高原雨点鸽与詹森鸽胸肌转录组差异表达基因筛选与功能分析)[J].浙江农业学报,2022(03):507-516
A类:
高原雨点鸽,詹森鸽,SMYD1,PPM1K,MYOD1,MGLL
B类:
胸肌,差异表达基因,基因筛选,功能分析,飞行能力,能力差异,关键基因,选育,体况,日龄,屠宰,转录组测序,差异基因,Ontology,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,蛋白质互作网络分析,骨骼肌细胞,细胞分化,细胞代谢,代谢过程,条目,通路分析,胰岛素信号通路,AMPK,STAT1,VEGFA,PLCE1,SOCS3,肌纤维直径,爆发力,白色脂肪,棕色脂肪,支链氨基酸,长距离,负重,更适宜,远距离
AB值:
0.205951
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