典型文献
变灰青霉线粒体基因组特征及系统发育分析
文献摘要:
本研究对一株分离自细虫草上的变灰青霉SFY00C3菌株线粒体基因组进行测定,分析其组成特征,并探究其与青霉属真菌的系统发育关系.结果表明,SFY00C3的线粒体基因组是一条长度为28 301 bp的环状DNA分子,共编码42个基因(15个蛋白编码基因、2个rRNA基因和25个tRNA基因),其碱基组成有显著的A-T偏好性,25个tRNA基因均可形成典型三叶草结构,并存在32处G-U错配.通过青霉属物种间共线性分析发现其线粒体基因组发生了基因重排;共有的14个蛋白编码基因的Ka/Ks值均小于1,表明受到了纯化选择压力的影响;系统发育分析表明:SFY00C3在青霉属中是一个独立的分支,应该是6种青霉祖先的姊妹.本研究丰富了变灰青霉的线粒体基因组序列信息,为青霉属的系统发育、资源保护及遗传多样性研究提供基础数据.
文献关键词:
变灰青霉;线粒体基因组;序列特征;系统发育
中图分类号:
作者姓名:
康瑞萍;艾菲热·阿布都艾尼;周慧英;索菲娅;丁明亮
作者机构:
新疆大学生命科学与技术学院,新疆乌鲁木齐830000;云南省农业科学院粮食作物研究所,云南昆明650000
文献出处:
引用格式:
[1]康瑞萍;艾菲热·阿布都艾尼;周慧英;索菲娅;丁明亮-.变灰青霉线粒体基因组特征及系统发育分析)[J].菌物学报,2022(04):518-528
A类:
变灰青霉,SFY00C3
B类:
线粒体基因组,基因组特征,系统发育分析,一株,虫草,组成特征,青霉属真菌,系统发育关系,bp,蛋白编码,编码基因,rRNA,tRNA,碱基组成,偏好性,三叶草,错配,种间,共线性分析,基因重排,Ka,Ks,选择压力,该是,祖先,姊妹,基因组序列,序列信息,资源保护,遗传多样性,多样性研究,序列特征
AB值:
0.290326
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。