典型文献
龙虾科物种线粒体基因组特征和系统发育分析
文献摘要：
综合分析了龙虾科(Palinuridae)13个物种线粒体基因组的全序列,发现其线粒体基因组的长度为15470～16105 bp,A+T含量为62.63％～67.11％.Ka/Ks分析表明,龙虾科中的10个龙虾属(Panulirus)物种线粒体13个蛋白质编码基因(protein-coding genes,PCGs)的Ka/Ks＜＜1,显示出很强的纯化选择;在差异位点的分析中,发现nd5、nd4、rrnL基因的差异位点比例较高,是理想的分子标记,可用于分析龙虾类不同群体之间的遗传多样性;密码子偏好性分析表明,被编码的氨基酸偏好性是相似的.同时,本研究采用ML(maximum likelihood)和BI(Bayesian inference)方法构建系统发育树,结果显示,塔斯马尼亚龙虾属(Sagmiariasus)物种最先开始分化,而龙虾属单独聚为一支,且与脊龙虾属(Linuparus)/游龙虾属(Puerulus)互为姊妹关系.贝叶斯分子钟估算结果显示,龙虾科物种可能起源于三叠纪,随后进一步分化为具有现代表征的龙虾种类.本研究旨在为快速鉴定龙虾科生物提供可靠的分子标记,并为分析龙虾科物种遗传多样性提供理论依据.
文献关键词：
龙虾科;线粒体基因组;结构特征;系统发育
中图分类号：
作者姓名：
朱雷宇;朱志煌;朱陇强;林琪
作者机构：
上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;福建省水产研究所,福建厦门361013;福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,福建厦门361013
文献出处：
引用格式：
[1]朱雷宇;朱志煌;朱陇强;林琪-.龙虾科物种线粒体基因组特征和系统发育分析)[J].中国水产科学,2022(04):525-534
A类：
龙虾科,Palinuridae,nd5,rrnL,Sagmiariasus,Linuparus,Puerulus
B类：
线粒体基因组,基因组特征,系统发育分析,全序,bp,A+T,Ka,Ks,Panulirus,蛋白质编码基因,protein,coding,genes,PCGs,异位,nd4,分子标记,虾类,不同群体,密码子偏好性,偏好性分析,ML,maximum,likelihood,BI,Bayesian,inference,建系,系统发育树,塔斯马尼亚,亚龙,最先,姊妹,分子钟,三叠纪,现代表征,快速鉴定,物种遗传多样性
AB值：
0.306522
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