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牦牛卵泡发育过程中卵丘卵母细胞复合体的转录组分析
文献摘要：
为探讨牦牛有腔卵泡发育过程中卵丘卵母细胞复合体(Cumulus-oocyte complexes,COCs)mRNA转录组变化,对牦牛小(2～3 mm)、中(4～5 mm)、大有腔卵泡(6～8 mm)中的COCs进行Illumina平台测序,筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),并进行GO分析和KEGG分析.结果表明,1)牦牛小、中、大3个阶段的卵泡COCs中共有17 342个基因表达;2)小卵泡与中卵泡COCs之间有879个DEGs,其中,上调435个,下调444个;DEGs注释到106条GO条目,其中生物过程(BP)类别46条,细胞组成(CC)类别25条,分子功能(MF)类别35条,涉及254条KEGG通路.中卵泡与大卵泡COCs之间有1 560个DEGs,其中,上调590个,下调970个;3)DEGs注释到114条GO条目,其中BP 55条、CC 26条和MF 33条,涉及276条KEGG通路,DEGs主要富集在神经活性配体-受体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞粘附分子、钙离子信号通路和cAMP信号通路等重要通路.综上,牦牛卵泡在不同发育阶段的DEGs、GO条目和KEGG pathway存在明显差异,为揭示牦牛卵泡发育分子调控机制,改善牦牛卵母细胞体外成熟技术提供了理论依据.
文献关键词：
牦牛;卵丘卵母细胞复合体;转录组;转录组测序
中图分类号：
作者姓名：
何向东;字向东;夏忆;陈莹
作者机构：
西南民族大学动物科学国家民委重点实验室,成都610041
文献出处：
引用格式：
[1]何向东;字向东;夏忆;陈莹-.牦牛卵泡发育过程中卵丘卵母细胞复合体的转录组分析)[J].中国农业大学学报,2022(05):216-226
A类：
B类：
牦牛,卵泡发育,卵丘卵母细胞复合体,转录组分析,Cumulus,oocyte,complexes,COCs,Illumina,差异表达基因,Differentially,expressed,genes,DEGs,条目,生物过程,细胞组成,CC,MF,细胞因子受体,细胞粘附分子,钙离子信号通路,cAMP,发育阶段,pathway,育分,分子调控机制,卵母细胞体外成熟技术,转录组测序
AB值：
0.25943
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