[目的]探究牛卵巢小黄体细胞(SLCs)和膜细胞(TCs)中的差异表达基因,进而筛选与TCs黄体化密切相关的基因,为深入研究SLCs、TCs特异性及TCs向SLCs分化的机制提供参考.[方法]利用R软件limma包中的DESeq2,筛选GEO芯片数据库GSE83524数据集TCs和SLCs中的差异表达基因,再用goseq软件对筛选出的差异表达基因进行GO功能富集分析,用kobas软件进行KEGG信号通路分析,使用String结合Cytoscape软件进行PPI网络互作分析.采集思南黄牛颗粒细胞(GCs)和TCs,以RPLP0作为内参基因,用荧光定量PCR法对筛选出的与TCs增殖及黄体化相关的基因进行验证.[结果]共筛选获得237个差异表达基因,其中表达上调的基因115个,表达下调的基因122个.GO功能分析结果显示,参与生物学过程的有147个基因,占差异表达基因总数的53.6％,分别富集于30个组;参与细胞组分的有125个基因,占差异表达基因总数的21.4％,分别富集于12个组;参与分子功能的有98个基因,占差异表达基因总数的25.0％,分别富集于14个组.KEGG分析共发现17条通路,其中可能与卵泡内膜细胞黄体化相关的通路为FSHR、PLA2G4A、CYP19A1、CYP17A1等4个基因参与的卵巢类固醇生成通路.经过PPI网络互作分析,筛选出了前10位的hub基因.荧光定量PCR分析结果显示,FSHR、PPLA2G4A、CYP19A1、CYP17A1、BBUB1B和KIF20A在SLCs和TCs中的转录水平与GEO芯片数据结果一致,表现为FSHR、CYP19A1和CYP17A1在TCs中的表达量极显著高于其在SLCs中的表达量(P＜0.01),PPLA2G4A、BUB1B和KIF20A在TCs中的表达量亦显著高于其在SLCs中的表达量(P＜0.05).[结论]差异表达基因FSHR、PLA2G4A、CYP19A1、CYP17A1、BBUB1B和KIF20A在牛优势卵泡TCs增殖分化形成黄体的过程中发挥关键作用.

牛;差异表达基因;膜细胞;小黄体细胞;黄体化

孟金柱;伍春亚;潘春威;安清明;吴震洋;赵园园

铜仁学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,贵州铜仁554300;湖南农业大学动物医学院,湖南长沙410128

西北农林科技大学学报（自然科学版）

[1]孟金柱;伍春亚;潘春威;安清明;吴震洋;赵园园-.牛优势卵泡膜细胞黄体化相关基因的筛选)[J].西北农林科技大学学报（自然科学版）,2022(03):1-9

黄体化,小黄体细胞,goseq,kobas,思南黄牛,RPLP0,PLA2G4A,PPLA2G4A,BBUB1B

优势卵泡,膜细胞,SLCs,TCs,差异表达基因,limma,DESeq2,GEO,GSE83524,功能富集分析,通路分析,String,Cytoscape,PPI,互作分析,颗粒细胞,GCs,内参基因,功能分析,生物学过程,内膜,FSHR,CYP19A1,CYP17A1,类固醇,hub,KIF20A,转录水平,数据结果,增殖分化

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