典型文献
广西新型鸭呼肠孤病毒流行毒株GX01-2020全基因组分子特征分析
文献摘要：
为了解广西新型鸭呼肠孤病毒(novel duck reovirus,NDRV)流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段进行全基因组序列扩增,经克隆、测序、拼接后,获得1株NDRV全基因组序列(命名为GX01-2020株).结果显示,GX01-2020株基因组全长23 353 bp,分为10个片段,大小从1 194 bp(S4)至3 958 bp(L1)不等.同源性分析显示,GX01-2020株10个片段核苷酸同源性与NDRV代表毒株最高,为86.2％～99.4％,其中μ B片段核苷酸同源性最低的毒株为番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV),其他片段则为鸡源禽呼肠孤病毒(chicken-origin reovi-rus,CRV),说明不同片段来源祖先不完全相同.遗传进化分析显示,10个片段遗传进化树中,L2、L3片段中MDRV参考毒株及a A片段中NDRV参考毒株均形成两个进化分支,与其他片段不同,说明不同片段与参考毒株的遗传关系不尽相同.重组分析显示,GX01-2020株的L1片段存在重组信号,重组亲本毒株分别为北京MDRV_J18株和福建DRV_NP03株.本研究丰富了 NDRV基因库相关信息,同时为广西地区NDRV的分子流行病学研究和有效防制措施制订提供了一定的参考.
文献关键词：
新型鸭呼肠孤病毒(NDRV);全基因组测序;遗传进化
中图分类号：
作者姓名：
谢守玉;刘惠心;周媛;熊陈勇;施开创;屈素洁;苏文广;温新瑞;李媛;李春英;邓桂潮;尹彦文
作者机构：
广西壮族自治区动物疫病预防控制中心,广西南宁530001;广西大学动物科学技术学院,广西南宁530005;北海市动物疫病预防控制中心,广西北海536000;钦州市动物疫病预防控制中心,广西钦州535099;浦北县动物疫病预防控制中心,广西钦州535300
文献出处：
引用格式：
[1]谢守玉;刘惠心;周媛;熊陈勇;施开创;屈素洁;苏文广;温新瑞;李媛;李春英;邓桂潮;尹彦文-.广西新型鸭呼肠孤病毒流行毒株GX01-2020全基因组分子特征分析)[J].中国兽医学报,2022(04):643-650,661
A类：
Muscovy,reovi,NP03
B类：
新型鸭呼肠孤病毒,流行毒株,GX01,分子特征,novel,duck,reovirus,NDRV,分子遗传,遗传特征,分段进行,全基因组序列,拼接,基因组全长,bp,S4,L1,同源性分析,番鸭,MDRV,禽呼肠孤病毒,chicken,origin,CRV,祖先,完全相同,遗传进化分析,遗传进化树,L2,L3,进化分支,遗传关系,重组分析,亲本,J18,基因库,广西地区,分子流行病学,流行病学研究,防制措施,全基因组测序
AB值：
0.289731
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