典型文献
鸭星状病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立
文献摘要:
鸭星状病毒3型(Duck astrovirus-3,DAstV-3)是近年来危害我国养鸭业的新发病原.本研究根据前期从樱桃谷鸭(Anas platyrhynchos domestica)胚中分离鉴定的DAstV-3分离株及已报道毒株的RNA依赖性的核糖核酸聚合酶基因(RNA-dependent RNA polymerase,RDRP)特征设计特异性引物,建立检测DAstV-3的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法.结果表明,该方法的标准曲线循环域值(Ct)与标准品模板浓度在1.15×101~1.15×107拷贝/μL间线性关系良好,相关系数R2和扩增效率分别为0.999和2.08;该方法特异性强,仅可检出DAstV-3,而对鸭常见疫病病原(DAstV-1,DAstV-2,禽流感病毒H9(H9 subtype Avian influenza virus),禽坦布苏病毒(Avian tambusu virus),鸭呼肠孤病毒(Duck reovirus),番鸭细小病毒(Muscovy parvovirus))检测均为阴性;灵敏度高,其最低检测下限为23拷贝;并且重复性好,批内和批间重复试验变异系数分别为0.14%~0.65%和0.53%~0.94%,均低于1%.利用该方法对2018年6月至2021年3月的209份疑似DAstV-3感染病例样品进行检测,DAstV-3的阳性检出率为56.5%(118/209).综上结果表明,本研究所建立的方法特异性强、灵敏度高、稳定性好,为DAstV-3感染的快速诊断和流行病学监测提供了有力的技术支持.
文献关键词:
鸭星状病毒3型(DAstV-3);RNA依赖性的核糖核酸聚合酶(RDRP);SYBR GreenⅠ;实时荧光定量PCR
中图分类号:
作者姓名:
傅秋玲;张蕊;傅光华;万春和;程龙飞;施少华;陈红梅;刘荣昌;黄瑜
作者机构:
福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福州350013;福建省禽病防治重点实验室,福州350013
文献出处:
引用格式:
[1]傅秋玲;张蕊;傅光华;万春和;程龙飞;施少华;陈红梅;刘荣昌;黄瑜-.鸭星状病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立)[J].农业生物技术学报,2022(04):817-824
A类:
RDRP,tambusu,Muscovy
B类:
星状病毒,SYBR,Green,Duck,astrovirus,DAstV,养鸭业,究根,樱桃谷鸭,Anas,platyrhynchos,domestica,分离鉴定,分离株,毒株,核糖核酸,酶基因,dependent,polymerase,特异性引物,标准曲线,Ct,标准品,拷贝,法特,常见疫病,禽流感病毒,H9,subtype,Avian,influenza,禽坦布苏病毒,鸭呼肠孤病毒,reovirus,番鸭细小病毒,parvovirus,灵敏度高,检测下限,复试,感染病,阳性检出率,快速诊断,学监
AB值:
0.328109
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