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典型文献
甘肃省苹果坏死花叶病毒检测及遗传多样性分析
文献摘要:
为明确甘肃省苹果坏死花叶病毒(apple necrotic mosaic virus,ApNMV)的发生及遗传变异情况,采用反转录PCR方法对采自甘肃7个地区表现花叶症状和无明显症状的共93份苹果叶片样品进行了检测.结果显示ApNMV的平均检出率为66.67%,说明其在甘肃省苹果产区普遍发生.对其中9份样品中ApNMV的外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行了克隆和测序,其分离物CP的核苷酸和编码蛋白氨基酸序列相似性分别为92.3%~99.7%和93.6%~99.1%,与NCBI数据库中来自中国、印度、日本等国家的18个ApNMV分离物核苷酸和氨基酸序列相似性分别为86.7%~99.7%和87.1%~99.7%.基于CP基因全长序列构建的系统发育树,ApNMV分离物聚集成5个组,9个ApNMV甘肃分离物与其他ApNMV分离物分别聚集形成组Ⅰ、组Ⅱ和组V.9条ApNMV全长CP基因序列中检测到1个潜在重组事件.
文献关键词:
苹果;ApNMV;CP;RT-PCR;遗传多样性;重组
作者姓名:
李世帆;邵宇纯;祁豪男;杨兰;李小伟;徐秉良;陈雅寒
作者机构:
甘肃农业大学植物保护学院,兰州730070
文献出处:
引用格式:
[1]李世帆;邵宇纯;祁豪男;杨兰;李小伟;徐秉良;陈雅寒-.甘肃省苹果坏死花叶病毒检测及遗传多样性分析)[J].园艺学报,2022(11):2431-2438
A类:
ApNMV
B类:
花叶病毒,病毒检测,遗传多样性分析,apple,necrotic,mosaic,virus,遗传变异,变异情况,自甘,苹果叶片,外壳蛋白,coat,protein,CP,分离物,编码蛋白,氨基酸序列,NCBI,基因全长序列,系统发育树,成组,基因序列
AB值:
0.255085
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