典型文献
侵染湖北圆叶牵牛的甘薯曲叶病毒分子鉴定及遗传进化分析
文献摘要：
[目的]明确湖北省荆州市1株表现黄脉的圆叶牵牛的病毒病原,为该类病害的防控提供理论依据.[方法]从湖北省荆州市采集1株表现黄脉、卷叶的圆叶牵牛植株叶片,采用双生病毒简并引物PA、PB进行PCR检测,通过分段克隆、核苷酸序列比对分析和进化树构建等方法对获得的全长基因组序列进行比对及遗传进化分析.[结果]PCR检测结果显示,采集的样品中可扩增一条大小为363 bp的目的靶标序列,证实所采集的圆叶牵牛植株受到双生病毒的侵染;通过分段克隆的方法从阳性样品中拼接获得一条全长为2827 bp的全基因组序列,核苷酸相似性比较发现,该序列与GenBank已登录序列的甘薯曲叶病毒(Sweet Potato Leaf Curl Virus,SPLCV)各分离物的相似性均在91％以上,其中与湖南分离物(GenBank登录号:KY783941)和江苏分离物(GenBank登录号:FJ176701)的核苷酸序列相似性分别为97.52％ 和96.81％,根据国际病毒分类委员会对菜豆金色黄花叶病毒属病毒种核苷酸相似性>91％为同一病毒的分类标准,确定侵染圆叶牵牛的双生病毒为SPLCV的一个分离物.进化树分析发现,该分离物(GenBank登录号:OM287440)与中国及多个亚洲分离物处于一个大分支,特别是与湖南分离物处于同一小分支,说明该研究获得的分离物与湖南分离物具有较近的亲缘关系.[结论]侵染湖北圆叶牵牛的病原为SPLCV,而该病毒可能通过种苗或烟粉虱经湖南传入.该研究为SPLCV侵染湖北牵牛花的首次报道.
文献关键词：
湖北;圆叶牵牛;甘薯双生病毒;甘薯曲叶病毒;序列分析
中图分类号：
作者姓名：
罗婉笛;王鹏;莫翠萍;蔡健和;章松柏;李战彪
作者机构：
长江大学农学院/农林病虫害预警与调控湖北省工程技术研究中心,湖北荆州 434025;广西农业科学院植物保护研究所/农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室/广西作物病虫害生物学重点实验室,广西南宁 530007
文献出处：
引用格式：
[1]罗婉笛;王鹏;莫翠萍;蔡健和;章松柏;李战彪-.侵染湖北圆叶牵牛的甘薯曲叶病毒分子鉴定及遗传进化分析)[J].广东农业科学,2022(10):96-103
A类：
甘薯曲叶病毒,KY783941,FJ176701,OM287440,甘薯双生病毒
B类：
侵染,圆叶牵牛,分子鉴定,遗传进化分析,荆州市,病毒病,卷叶,植株,简并引物,PA,PB,序列比对,比对分析,进化树构建,全长,bp,靶标,拼接,接获,全基因组序列,GenBank,Sweet,Potato,Leaf,Curl,Virus,SPLCV,分离物,登录号,菜豆,金色,黄花叶病,花叶病毒,毒种,分类标准,进化树分析,一小,亲缘关系,原为,种苗,烟粉虱,传入,牵牛花,首次报道,序列分析
AB值：
0.258474
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