典型文献
建兰花叶病毒广东分离物的全基因组序列分析
文献摘要：
[目的]建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CymMV)是最主要的兰花病毒病原之一,其广泛传播对兰花产业发展造成严重威胁.探究CymMV遗传信息和进化,为广东省兰花病毒病的监测预警和兰花抗病毒病基因工程提供重要科学依据.[方法]对采自广州地区的墨兰疑似病毒病叶片进行CymMV的RT-PCR及DA-SELISA检测鉴定,利用相关分子生物学软件对CymMV分离物进行基因组序列组装、注释、系统进化及选择压力分析.[结果]首次在广东省发现2个CymMV分离物GZV013和ZC-29,基因组全长均为6227 nt,编码5个功能蛋白;GZV013与台湾分离物M2的核苷酸序列一致性为97.03％;ZC29与南京分离物NJ-1的核苷酸序列一致性为97.11％;CymMV各分离物的全基因组序列一致性为86.85％～98.31％,且多样性种群的分化与寄主种类和地理隔离关系密切;CymMV基因组每个区域均受到负选择的影响,并符合中性进化模型;编码RdRp、TGB1和TGB2的基因在基因组中变异率最高.[结论]GZV013与台湾分离物M2的亲缘关系最近,ZC29与南京分离物NJ-1的亲缘关系最近,同属于一个分支.
文献关键词：
兰科植物;病毒检测;建兰花叶病毒(CymMV);序列分析;选择压力
中图分类号：
作者姓名：
魏永路;任锐;高洁;刘伟平;谢琦;朱根发;杨凤玺
作者机构：
广东省农业科学院环境园艺研究所/广东省园林花卉种质创新与利用重点实验室,广东 广州 510640;广东翁山兰花研究有限公司,广东 韶关 512600
文献出处：
引用格式：
[1]魏永路;任锐;高洁;刘伟平;谢琦;朱根发;杨凤玺-.建兰花叶病毒广东分离物的全基因组序列分析)[J].广东农业科学,2022(02):109-117
A类：
SELISA,GZV013,ZC29,TGB1,TGB2
B类：
建兰花叶病毒,分离物,全基因组序列分析,Cymbidium,mosaic,virus,CymMV,病毒病,广泛传播,遗传信息,监测预警,抗病毒,基因工程,广州地区,墨兰,DA,检测鉴定,分子生物学,系统进化,选择压力,压力分析,基因组全长,nt,功能蛋白,台湾,M2,序列一致性,NJ,寄主,地理隔离,RdRp,亲缘关系,同属,兰科植物,病毒检测
AB值：
0.237288
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