典型文献
云南省番茄莴苣褪绿病毒分子检测及遗传进化分析
文献摘要：
采集了77份云南省疑似感染莴苣褪绿病毒(lettuce chlorosis virus,LCV)的番茄样本,采用特异性反转录PCR扩增LCV次要外壳蛋白基因(minor coat protein,CPm)近全长序列,常规Sanger测序法测定相应片段序列,并对其进行遗传进化分析.结果 表明,LCV特异性反转录PCR扩增得到与预期大小(1.38 kb)一致的特异性条带;采集的77份番茄样本中LCV检出率为12.99％.测定的LCV CPm;发育分析表明,所有LCV分离物可分为3个亚簇,具有明显的地域特性,其中LCV云南分离物与中国其他地区LCV分离物聚为一亚簇,来自美洲和欧洲分离物分别聚为一个簇.遗传进化分析表明,LCV云南分离物YN58有1个重组事件,序列中嘧啶(C/T)替换率最高(25.25),呈现独立进化、加速扩展趋势.这是在云南省首次报道发现LCV.
文献关键词：
番茄;莴苣褪绿病毒;分子检测;系统发育分析;进化
中图分类号：
作者姓名：
冯丽肖;胡荣;卜姗;张德咏;罗香文;李凡;丁铭;张卓;张松柏;刘勇
作者机构：
湖南大学研究生院隆平分院,长沙410125;湖南省农业科学院植物保护研究所,长沙410125;云南农业大学植物保护学院,昆明650201;云南省农业科学院,昆明650231
文献出处：
引用格式：
[1]冯丽肖;胡荣;卜姗;张德咏;罗香文;李凡;丁铭;张卓;张松柏;刘勇-.云南省番茄莴苣褪绿病毒分子检测及遗传进化分析)[J].园艺学报,2022(01):141-147
A类：
莴苣褪绿病毒,CPm,YN58
B类：
番茄,分子检测,遗传进化分析,lettuce,chlorosis,virus,LCV,外壳蛋白基因,minor,coat,protein,全长,Sanger,段序列,kb,条带,分离物,美洲,嘧啶,替换率,首次报道,系统发育分析
AB值：
0.231644
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