典型文献
云南省猪圆环病毒2型遗传进化分析
文献摘要：
[目的]调查猪圆环病毒2型(PCV2)在云南猪群和牛群中的流行情况,明确云南PCV2毒株的遗传变异、分子进化趋势.[方法]采用PCR方法对云南省11个地区783份猪、牛的血液、粪便等样品进行PCV2病原学检测,对6份PCV2阳性样品进行全基因组扩增、克隆与序列测定,利用DNAStar软件比对分析全基因和ORF2氨基酸序列,使用MEGA软件绘制遗传进化树.[结果]检测样品的PCV2阳性率为48.73％;共测得6株PCV2全基因组序列,其中5株为1767 bp,1株为1768 bp;经遗传发育分析可知,有PCV2a亚型2株、PCV2b亚型2株、PCV2d亚型2株;6株PCV2毒株同源性在94.6％～99.9％之间,与GenBank数据库中20条参考株同源性在91.4％～99.8％之间;6株PCV2亚型的ORF2都有其典型的氨基酸位点,PCV2a毒株在第80(V80L)氨基酸位点突变为与PCV2(b/d)一致,PCV2b毒株在59(R59K)、63(K63R)、190(A190T)等氨基酸位点突变与PCV2d一致.[结论]PCV2在云南猪群中普遍存在,以PCV2a、PCV2b和PCV2d这3个基因亚型共存为主,且PCV2(a/b)有向PCV2d突变的趋势,荷斯坦奶牛尚未感染PCV2.
文献关键词：
PCV2;ORF2;进化;突变;流行;感染
中图分类号：
作者姓名：
何帅;章雨竹;吕念词;张以芳;柴俊
作者机构：
眉山职业技术学院,云南眉山 620010;云南农业职业技术学院,云南昆明 650031;云南农业大学,云南昆明 650201
文献出处：
引用格式：
[1]何帅;章雨竹;吕念词;张以芳;柴俊-.云南省猪圆环病毒2型遗传进化分析)[J].广东农业科学,2022(12):110-117
A类：
V80L,R59K,K63R,A190T
B类：
猪圆环病毒,遗传进化分析,猪群,和牛,牛群,流行情况,毒株,遗传变异,分子进化,进化趋势,粪便,病原学检测,全基因组扩增,序列测定,DNAStar,软件比对,比对分析,ORF2,氨基酸序列,MEGA,遗传进化树,检测样品,共测,全基因组序列,bp,育分,PCV2a,PCV2b,PCV2d,同源性,GenBank,氨基酸位点,位点突变,基因亚型,存为,荷斯坦奶牛,未感染
AB值：
0.294725
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