典型文献
广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因遗传变异分析
文献摘要:
[目的]监测2021年广东地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus,PRRSV)的分子流行动态,为PRRSV综合防控措施的制定提供参考.[方法]在广东省内不同地区PRRSV检测为阳性的37个规模猪场采集521份患病猪组织样本进行PRRSV检测.对样本进行ORF5基因测序,采用DNAStar分析ORF5核苷酸的同源性及其推导氨基酸的同源性,并用Mega7.0构建基于ORF5基因的系统遗传进化树.[结果]从37个猪场采集的样品PRRSV阳性率为24.4%,猪场阳性率为45.9%.通过测序分析获得17株来自不同猪场的PRRSV ORF5基因序列,遗传进化分析表明所有毒株均属于北美毒株(PRRSV 2),其中有5株属于Lineage 8(JXA1-like和CH-1a-like)谱系,9株属于Lineage 1(NADC30-like和NADC34-like)谱系,3株属于Lineage 3(QYYZ-like)谱系,没有监测到Lineage 5(VR2332-like)谱系的毒株.17株PRRSV毒株的ORF5基因之间核苷酸序列同源性为81.3%~99.5%,推导的氨基酸序列同源性为80.0%~98.3%.[结论]2021年广东省PRRSV流行株以Lineage 1(NADC30-like和NADC34-like)和Lineage 8(JXA1-like和CH-1a-like)谱系为主,占比分别为52.94%和29.41%,Lineage 3(QYYZ-like)谱系降为次要流行株,占比为17.65%.
文献关键词:
猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV);ORF5基因;NADC30毒株;NADC34毒株;遗传变异
中图分类号:
作者姓名:
蒋智勇;楚品品;陈天宝;李春玲;蔡汝健
作者机构:
广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室/农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站,广东 广州 510640
文献出处:
引用格式:
[1]蒋智勇;楚品品;陈天宝;李春玲;蔡汝健-.广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因遗传变异分析)[J].广东农业科学,2022(04):97-105
A类:
B类:
猪繁殖与呼吸综合征病毒,ORF5,基因遗传变异,遗传变异分析,广东地区,Porcine,Reproductive,Respiratory,Syndrome,Virus,PRRSV,分子流,流行动态,综合防控措施,规模猪场,病猪,基因测序,DNAStar,Mega7,系统遗传,遗传进化树,测序分析,基因序列,遗传进化分析,有毒,毒株,北美,Lineage,JXA1,like,CH,1a,NADC30,NADC34,QYYZ,VR2332,序列同源性,氨基酸序列,降为
AB值:
0.290336
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。