典型文献
云南微小扇头蜱线粒体基因组全序列测定与分析
文献摘要:
2017年9月采用布旗法在云南省临沧市耿马县采集游离的微小扇头蜱,提取蜱DNA,采用通用引物PCR扩增微小扇头蜱的16S rRNA、12S rRNA、nadi、cox3基因片段,采用长PCR扩增上述4个基因区的长片段,产物纯化后采用步移法测序,拼接获得线粒体基因组全序列.结果显示,线粒体基因组全长14 763 bp,包含13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA和1个长度为264 bp的非编码区(D-Loop区),碱基组成为A 38.66%、G 9.02%、C 11.46%、T 40.87%,(A+T)79.53%.蛋白质编码基因起始密码子均为ATN;除COX2、cox3、NAD5使用不完整T作为终止密码子外,其余基因终止密码子均为TAA或TAG;基因重叠区有12处共95 bp,长度在1~24 bp;基因间隔区有18处共433 bp,长度在1~311 bpo22个tRNA中,除tRNACys、tRNAPhe、tRNAser以外均能形成典型的三叶草结构.
文献关键词:
微小扇头蜱;线粒体基因组;序列分析
中图分类号:
作者姓名:
刘雅芳;陈彬;芦新焱;李光华;杜春红;姜丹丹;杨兴
作者机构:
大理大学基础医学院,大理671000;云南省地方病防治所,大理671000;大理大学公共卫生学院,大理671000
文献出处:
引用格式:
[1]刘雅芳;陈彬;芦新焱;李光华;杜春红;姜丹丹;杨兴-.云南微小扇头蜱线粒体基因组全序列测定与分析)[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2022(05):677-681
A类:
nadi,NAD5,bpo22,tRNAPhe
B类:
微小扇头蜱,线粒体基因组,全序列测定,用布,云南省临沧市,耿马,通用引物,16S,rRNA,12S,cox3,增上,长片,拼接,接获,基因组全长,蛋白质编码基因,非编码区,Loop,碱基组成,A+T,ATN,COX2,用不完,终止密码子,TAA,TAG,重叠区,基因间隔区,tRNACys,tRNAser,三叶草,序列分析
AB值:
0.355271
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