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典型文献
基于线粒体cox1基因序列云南省大理白族自治州亚洲带绦虫遗传多样性分析
文献摘要:
目的 了解云南省大理白族自治州亚洲带绦虫的群体结构.方法 对从大理白族自治州大理市、弥渡县、洱源县和漾濞彝族自治县采集的66份亚洲带绦虫样品,利用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增其cox1基因部分序列.使用DNASP 5.10.01和MEGA 7.0等软件对所得序列进行分析,得到片段碱基含量、遗传距离以及遗传多样性参数等数据,并通过构建系统发育树的方式,结合遗传多样性数据进行分析.结果 获得的66条亚洲带绦虫cox1基因片段大小均为510 bp,共有89个变异位点,平均A、T、C、G的碱基含量分别21.3%、48.4%、10.0%和20.3%;比对发现,66条基因序列共形成21个单倍型,核酸多样性和单倍型多样性分别为0.084 4和0.839;总群体Tajima's D检验值为显著负值;遗传距离为0.00066~0.087 85,大理市群体与漾濞县群体之间的遗传距离最大.结论 大理白族自治州亚洲带绦虫线粒体cox1基因具有丰富的遗传多样性,本研究为亚洲带绦虫的遗传多样性研究提供了基础数据.
文献关键词:
亚洲带绦虫;cox1基因;遗传多样性;云南省
作者姓名:
陈远腾;赵俊杰;张莉;庄尔俊;蔡倩文;李海龙;董玲
作者机构:
大理大学基础医学院,云南大理671000;云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室
引用格式:
[1]陈远腾;赵俊杰;张莉;庄尔俊;蔡倩文;李海龙;董玲-.基于线粒体cox1基因序列云南省大理白族自治州亚洲带绦虫遗传多样性分析)[J].河南预防医学杂志,2022(12):927-930
A类:
亚洲带绦虫,DNASP
B类:
cox1,基因序列,云南省大理白族自治州,遗传多样性分析,群体结构,大理市,弥渡县,洱源县,彝族,自治县,聚合酶链式反应,MEGA,碱基,遗传距离,遗传多样性参数,建系,系统发育树,bp,变异位点,共形,单倍型多样性,Tajima,负值,漾濞县,多样性研究
AB值:
0.200503
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