典型文献
四川省首起登革热本地传播疫情登革病毒全基因组特征及溯源分析
文献摘要：
目的 对2019年四川省发生的首起本地传播登革热疫情中检出的登革病毒进行全基因组测序,分析病毒分子生物学特征并探讨其可能的来源.方法 对实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测为阳性的本地病例标本提取核酸并扩增全基因组序列和测序,测序后进行同源性、系统进化分析和变异分析.结果 通过基因扩增和序列测定获得1株病毒全基因组序列和2株包括E基因的全基因组部分序列,全基因组序列全长10 706 bp,编码3 393个氨基酸;同源性和系统进化分析显示,本次疫情流行株与2019年我国广州市分离株、2019年广州市分离的柬埔寨输入株、2019年云南省分离株、2017年越南分离株以及2016年新加坡分离株的同源性较高,系统进化属于同一分支;与登革1型原型株相比本次流行株散在分布有589个核苷酸变异和64个氨基酸突变,但影响毒力的主要氨基酸位点没有改变.结论 2019年四川省首起登革热本地暴发疫情可能由柬埔寨输入病例引起,其病原体为登革1型病毒基因Ⅰ型;本次四川省流行株的毒力相关基因没有明显改变,但其在某些相关区域发生点突变的生物学意义有待进一步研究.
文献关键词：
登革热;本地疫情;登革病毒;分子溯源;全基因组特征
中图分类号：
作者姓名：
冯玉亮;林世华;潘明;曹一鸥;李伟
作者机构：
四川省疾病预防控制中心微生物检验所,四川成都610041
文献出处：
引用格式：
[1]冯玉亮;林世华;潘明;曹一鸥;李伟-.四川省首起登革热本地传播疫情登革病毒全基因组特征及溯源分析)[J].中国媒介生物学及控制杂志,2022(02):239-244
A类：
B类：
首起,登革热,登革病毒,全基因组特征,溯源分析,全基因组测序,分子生物学特征,qPCR,本地病例,全基因组序列,行同,同源性,系统进化分析,变异分析,基因扩增,序列测定,全长,bp,疫情流行,市分,分离株,柬埔寨,省分,越南,新加坡,比本,氨基酸突变,氨基酸位点,暴发疫情,输入病例,病原体,病毒基因,毒力相关基因,生点,点突变,生物学意义,本地疫情,分子溯源
AB值：
0.308487
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