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基于4种线粒体基因序列的广东省南雄市农区小型兽类DNA条形码分析
文献摘要：
目的 利用4种线粒体基因对广东省南雄市农田害鼠进行鉴定,探讨不同条形码基因应用于小型兽类鉴定的可靠性.方法 2019年在南雄市珠玑镇农田捕获110只鼠形动物样本,对部分样本通过提取基因组DNA、通用引物扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)、线粒体细胞色素B(Cytb)、16S rRNA和线粒体DNA控制区(D-loop)基因片段及测序,经同源性比对、遗传距离分析和系统发育树构建鉴定鼠种,并与传统形态学鉴定结果进行比较.结果 经过4种基因序列条形码分析,样本隶属于2目2科4属6种.其中臭鼩鼱D-loop不能扩增出条带,臭鼩鼱Cytb、黄毛鼠16S rRNA序列不能正确比对.不同鼠种及不同基因种内遗传距离均小于种间遗传距离.系统发育树显示,同一鼠种均聚为一支,支持率在99％以上,6个样本遗传学鉴定结果与形态学鉴定结果不同.结论 DNA条形码技术是传统形态学鉴定的有力补充,实际应用时,可依据数据库的完整性和准确性合理选择不同的条形码基因,并利用多基因相互验证,以保证鉴定结果准确.
文献关键词：
DNA条形码;小型兽类;种类鉴定;线粒体基因
中图分类号：
作者姓名：
姜洪雪;姚丹丹;林思亮;冯志勇
作者机构：
广东省农业科学院植物保护研究所,植物保护新技术重点实验室,广东广州510640
文献出处：
引用格式：
[1]姜洪雪;姚丹丹;林思亮;冯志勇-.基于4种线粒体基因序列的广东省南雄市农区小型兽类DNA条形码分析)[J].中国媒介生物学及控制杂志,2022(01):48-53
A类：
B类：
线粒体基因,基因序列,广东省南雄市,农区,小型兽类,农田害鼠,因应,珠玑,鼠形动物,动物样本,分样,通用引物,体细胞,细胞色素,亚基,Cytb,16S,rRNA,控制区,loop,同源性,遗传距离,系统发育树,传统形态学,形态学鉴定,隶属于,臭鼩,鼩鼱,条带,黄毛鼠,基因种,种内,种间,均聚,支持率,遗传学,条形码技术,多基因,相互验证,种类鉴定
AB值：
0.327133
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