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小鼠感染肝毛细线虫肝脏microRNA的差异表达分析
文献摘要：
目的 分析小鼠感染肝毛细线虫后肝脏microRNA(miRNA)的表达谱,筛选差异表达miRNA,为肝毛细线虫感染致肝纤维化机制研究提供资料.方法 6只雄性BABL/c小鼠随机分为肝毛细线虫感染组和对照组,每组3只.感染组小鼠经灌胃感染肝毛细线虫感染期虫卵(20个卵/鼠),对照组灌胃等量生理盐水.感染后35 d分别取感染组和对照组小鼠的肝组织,进行组织切片、苏木精-伊红(HE)染色后,镜下观察肝组织病变情况.提取和纯化小鼠肝组织总RNA进行文库构建和miRNA高通量测序.通过生物信息学分析筛选差异表达的miRNA,预测其靶基因并进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对部分差异表达miRNA进行验证分析.结果 肝组织切片的HE染色结果显示,感染组小鼠肝组织呈虫卵肉芽肿性病变,伴有明显的炎性细胞浸润;对照组肝细胞形态完整,未见炎性细胞浸润、变性坏死和纤维化.通过miRNA测序,筛选出差异表达的miRNA共16条,4条表达上调,且均上调2倍以上,其中mmu-miR-129-5p上调4倍以上;12条表达下调,均下调0.5倍以下,其中mmu-miR-21a-3p下调0.1倍以下.miRNA靶基因GO功能分析显示,富集的基因主要参与了信号转导、蛋白连接、转化酶活性、G蛋白偶联受体通路、细胞凋亡的负向调控、细胞增殖的正向调控、转录调控等;KEGG通路分析显示,富集的信号通路主要有Hippo信号通路、Ras信号通路、mTOR信号通路、磷脂类信号通路、Wnt信号通路.qRT-PCR检测结果显示,感染组2个上调基因mmu-miR-21a-3p和mmu-miR-181a-1-3p的相对表达水平分别为0.70±0.30和0.68±0.27,2个下调基因mmu-miR-409-5p和mmu-miR-129-5p的相对表达水平分别为1.27±0.24和2.61±0.52,与参考基因相比表达水平均与测序结果趋势一致.结论 肝毛细线虫感染导致小鼠肝组织miRNA表达谱发生了改变,mmu-miR-409-5p和mmu-miR-129-5p等基因可能是参与肝纤维化的候选基因.
文献关键词：
肝毛细线虫;miRNA;差异表达;肝纤维化
中图分类号：
作者姓名：
张雅兰;蒋甜甜;贺志权;邓艳;陈伟奇;朱岩昆;张红卫;赵东阳
作者机构：
河南省疾病预防控制中心,郑州 450016;河南省传染病病原生物重点实验室,郑州 450016
文献出处：
引用格式：
[1]张雅兰;蒋甜甜;贺志权;邓艳;陈伟奇;朱岩昆;张红卫;赵东阳-.小鼠感染肝毛细线虫肝脏microRNA的差异表达分析)[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2022(01):56-60,67
A类：
肝毛细线虫
B类：
microRNA,差异表达分析,miRNA,表达谱,肝纤维化,BABL,灌胃,感染期,虫卵,等量,生理盐水,组织切片,苏木,木精,伊红,HE,肝组织病变,文库构建,生物信息学分析,靶基因,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,富集分析,qRT,验证分析,染色结果,肉芽肿,性病变,炎性细胞浸润,肝细胞,细胞形态,出差,mmu,5p,21a,3p,功能分析,信号转导,转化酶,偶联,转录调控,通路分析,Hippo,Ras,mTOR,磷脂,脂类,Wnt,181a,相对表达,参考基因,候选基因
AB值：
0.210865
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