典型文献
细胞因子/趋化因子在单纯疱疹病毒脑炎小鼠表达及生物信息学分析
文献摘要:
目的 探讨单纯疱疹病毒脑炎(herpes simplex encephalitis,HSE)中细胞因子/趋化因子谱的表达情况,确定差异表达的因子及其相关的生物信息学作用.方法 单纯疱疹病毒1型(HSV-1)接种于Vero细胞,Reed-Muench法测定病毒滴度;实验组小鼠鼻腔接种HSV-1,建立动物感染模型,观察至接种后第7天,处死小鼠,左半脑制备石蜡切片用于病理学检测,右半脑制备脑组织匀浆用于观察其致Vero细胞病变作用及高通量细胞因子/趋化因子表达谱芯片检测.GO、KEGG和PPI等分析技术用于差异表达蛋白的生物信息学研究.结果 实验组小鼠接种HSV-1后几乎都出现了病毒性脑炎的症状(发病率为100%),7 d内15只小鼠中死亡3只(死亡率20%),而对照组小鼠均正常,但实验组动物的发病率和死亡率与正常对照组相比差异无统计学意义(P>0.05).脑组织病理学检测发现实验组小鼠脑组织轻度水肿伴大量炎性细胞浸润,见少量出血灶,对照组小鼠脑组织正常.实验组小鼠脑组织匀浆接种Vero细胞后发现大量细胞脱落、融合,出现明显的细胞病变效应,对照组细胞无明显改变.脑组织匀浆经PCR扩增出了病毒UL36的基因片段,而对照组未扩增出.细胞因子/趋化因子芯片于实验组筛选出了7个差异表达蛋白,GO富集分析发现其涉及多个生物学过程,与炎性细胞的活化和趋化有关;KEGG通路富集分析筛选出了 7个有意义的信号通路,涉及TNF信号通路和NOD样受体信号通路等;PPI分析发现大多数差异表达蛋白组成了一个相互作用网络,其中IL-6、IL-1、IFN-γ和TNF-α是该网络的主要因子.结论 单纯疱疹病毒脑炎小鼠模型中筛选出了7种差异表达的细胞因子/趋化因子,和与之相关的信号通路可能参与了 HSE的病理生理机制.
文献关键词:
单纯疱疹病毒Ⅰ型;脑炎;细胞因子/趋化因子;生物信息学分析
中图分类号:
作者姓名:
程易;马粤婷;吴日红;徐瑜;杨舒凌;林英姿;王永霞
作者机构:
海南医学院热带医学院,海南海口 571199
文献出处:
引用格式:
[1]程易;马粤婷;吴日红;徐瑜;杨舒凌;林英姿;王永霞-.细胞因子/趋化因子在单纯疱疹病毒脑炎小鼠表达及生物信息学分析)[J].中国热带医学,2022(03):234-239
A类:
细胞病变作用,UL36
B类:
趋化因子,单纯疱疹病毒脑炎,生物信息学分析,herpes,simplex,encephalitis,HSE,HSV,Vero,Reed,Muench,病毒滴度,鼻腔,动物感染模型,处死,石蜡切片,右半,匀浆,表达谱芯片,芯片检测,PPI,差异表达蛋白,生物信息学研究,病毒性脑炎,发病率和死亡率,正常对照,组织病理学,小鼠脑组织,炎性细胞浸润,少量出,出血灶,细胞病变效应,生物学过程,通路富集分析,NOD,样受体,蛋白组成,相互作用网络,IFN,小鼠模型,种差,病理生理机制
AB值:
0.227917
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