典型文献
可诱导共刺激分子高表达的T细胞刺激对人主动脉平滑肌细胞基因表达谱的影响
文献摘要:
目的 可诱导共刺激分子(ICOS)高表达的T细胞(JurKatT1CoS)刺激人主动脉平滑肌细胞(HASMC),分析HASMC基因表达水平变化,筛选并确定HASMC表型变化的关键基因.方法 JurKat T1Cos细胞、JurKat T细胞(ICOS正常表达的T细胞)分别与HASMC共培养,转录组测序技术(RNA-seq)分析HASMC表达谱,对差异表达基因(P≤0.05、|log2Fold Change|≥1.O)进行聚类分析、基因本体论(GO)功能富集分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,分析HASMC表型转化相关的信号通路基因变化情况.采用qRT-PCR对部分关键差异表达基因进行验证.结果 JurKat TCOS细胞与HASMC共培养组、JurKat T细胞与HASMC共培养组之间比较发现435个差异基因(P≤0.05,|log2Fold Change1≥1.0),其中375个基因表达上调(86.2%),60个基因表达下调(13.8%).GO功能富集结果表明,这些基因参与了细胞活化、细胞粘附、调节免疫效应过程、白细胞迁移、血小板活化、细胞趋化作用、免疫突触的组成;KEGG富集分析结果表明,差异基因参与了 Fcγ受体介导的吞噬作用、细胞周期信号通路、细胞粘附分子、T细胞受体信号通路等.将RNA-seq差异基因映射到平滑肌细胞表型转化的相关信号通路上,发现有34个差异基因(P≤0.05,|Fold Change|≥1.5)富集到PI3K/Akt信号通路上.利用qRT-PCR技术对其中10个关键基因进行验证,验证结果与RNA-seq趋势一致.结论 JurKatTCoS细胞刺激HASMC对HASMC基因表达谱具有影响,HASMC表型转化过程中PI3K/Akt信号通路可能发挥着主要的调控作用,为阐明ICOS过表达的T细胞对HASMC的作用提供了实验依据.
文献关键词:
可诱导共刺激分子;主动脉平滑肌细胞;T细胞;基因
中图分类号:
作者姓名:
梁梦;钟志雄
作者机构:
赣南医学院第一临床医学院,江西赣州341000;梅州市人民医院心血管病中心,广东梅州514031
文献出处:
引用格式:
[1]梁梦;钟志雄-.可诱导共刺激分子高表达的T细胞刺激对人主动脉平滑肌细胞基因表达谱的影响)[J].热带医学杂志,2022(05):612-617,629,后插1
A类:
JurKatT1CoS,JurKat,T1Cos,log2Fold,TCOS,Change1,JurKatTCoS
B类:
可诱导共刺激分子,人主动脉平滑肌细胞,基因表达谱,ICOS,HASMC,基因表达水平,表达水平变化,关键基因,共培养,转录组测序技术,seq,差异表达基因,基因本体论,功能富集分析,京都基因和基因组百科全书,通路富集分析,路基,qRT,差异基因,集结,细胞活化,调节免疫,免疫效应,白细胞迁移,血小板活化,细胞趋化,趋化作用,突触,Fc,吞噬作用,细胞周期信号通路,细胞粘附分子,细胞受体,射到,细胞表型转化,PI3K,Akt,转化过程,过表达
AB值:
0.189158
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