目的 关于lncRNAs作为预测性生物标志物和治疗靶点的研究仍然非常有限.文中旨在筛选出HBV相关肝癌差异表达lncRNA谱,寻找灵敏性高、特异性好的HBV相关肝癌早期诊断分子标志物. 方法 从GEO下载HBV相关肝癌芯片数据集GSE55092、GSE19665和GSE84402,筛选出差异表达的lncRNA和mRNA,并对差异基因进行功能分析.收集2019年2月至2020年12月右江民族医学院附属医院肝胆外科及体检科患者.肿瘤组(n=45)为HBV阳性原发性肝癌患者,对照组(n=38)为乙肝病毒携带无肿瘤患者.筛选差异表达基因,及HBV相关HCC的候选诊断lncRNA生物标志物,利用DAVID对共表达的差异基因进行GO富集分析及KEGG分析,利用qRT?PCR检测候选lncRNA在血浆样本的相对表达量,通过ROC曲线评价单个血浆lncRNA及与甲胎蛋白联合在HBV相关肝癌诊断中的价值. 结果 随机森林的特征变量筛选出上调的AC093642.1、AL445524.1、TRIM52?AS1、EHMT2?AS1、AL356056.2,及下调的AC003991.1、LINC00844、LINC01018、AC008040.1作为HBV相关肝癌的候选诊断性lncRNA生物标志物.候选lncRNA与126个mRNA存在共表达,共199个mR?NA?lncRNA共表达对.共表达mRNA的GO功能富集结果表明,表达失调的基因主要富集于与单羧酸代谢过程、类固醇代谢过程、细胞分裂、有丝分裂细胞周期过程等.KEGG通路分析显示,差异基因主要富集在p53信号通路、视黄醇代谢、PI3K?Akt信号通路、化学致癌作用和过氧化物酶体等信号通路.AC003991.1、AL445524.1、LINC00844、AL56056.2、AC008040.1、TRIM52?AS1、LINC01018肿瘤组与对照组比较差异有统计学意义,肿瘤组表达上调(P<0.05).ROC曲线分析结果显示,AC003991.1、AL445524.1、LINC00844和LINC010184种lncRNA联合构建logistic回归模型的AUC为0.910,敏感度和特异度分别为0.828、0.911;4?lncRNA与甲胎蛋白联合构建logistic回归模型的AUC为0.986,敏感度和特异度分别为0.969、0.964. 结论 血浆lncRNA AL356056.2、AL445524.1、TRIM52?AS1、AC008040.1、AC003991.1、LINC00844和LINC01018可作为HBV相关肝癌临床诊断潜在的循环标志物;AL445524.1、AC003991.1、LINC00844、LINC01018联合及与甲胎蛋白联合,对HBV相关肝癌具有早期诊断价值.

乙型肝炎病毒;长链非编码RNA;GEO;甲胎蛋白

农顺强;陈晓昊;许桂丹;韦武均;彭彬;周律;邓益斌

533000 百色,右江民族医学院附属医院检验科

医学研究与战创伤救治

[1]农顺强;陈晓昊;许桂丹;韦武均;彭彬;周律;邓益斌-.基于lncRNA⁃mRNA共表达网络的HBV相关肝癌生物靶点筛选及综合分析)[J].医学研究与战创伤救治,2022(04):376-382

GSE55092,GSE19665,GSE84402,AC093642,AL445524,TRIM52,AL356056,AC003991,LINC00844,LINC01018,AC008040,AL56056,LINC010184

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