典型文献
狍茸顶端组织转录组测序及生物信息学分析
文献摘要：
为研究狍茸顶端组织的转录组信息,探讨与狍茸生长相关的基因结构及分子机理.使用Illumina HiseqTM 2000平台进行高通量测序,利用生物信息学方法进行分析.结果表明:通过测序、Trinity软件组装、比对拼接,获得了 36 865个Unigenes,平均长932 nt.经过Nr、Swiss-Prot、KEGG、COG、GO等数据库进行比对,共22 983个Unigenes成功比对上Nr数据库,18 273个Unigenes被注释到GO功能分类中,8 668个Unigenes被归类到COG的25个功能类别中.采用FPKM法筛选与狍茸生长发育相关的高表达基因,其中表达量较高的生长因子有8个,转录因子有5个,细胞外基质有8个.利用高通量转录组测序技术(RNA-seq),成功建立了狍茸顶端组织转录组数据库,可为狍茸的发育分子机理研究提供数据支持.
文献关键词：
狍;转录组测序;狍茸顶端组织;RNA-seq技术
中图分类号：
作者姓名：
王春花;赵姬臣;夏彦玲
作者机构：
东北林业大学野生动物与自然保护地学院,哈尔滨150040
文献出处：
引用格式：
[1]王春花;赵姬臣;夏彦玲-.狍茸顶端组织转录组测序及生物信息学分析)[J].经济动物学报,2022(02):107-112
A类：
狍茸顶端组织
B类：
生物信息学分析,长相,基因结构,分子机理,Illumina,HiseqTM,利用生物,生物信息学方法,Trinity,拼接,Unigenes,nt,Nr,Swiss,Prot,COG,功能分类,FPKM,高表达基因,细胞外基质,高通量转录组测序技术,转录组数据,育分
AB值：
0.282832
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