典型文献
不同腹脂率番鸭回肠转录组差异分析
文献摘要：
[目的]解析番鸭回肠组织中与腹脂沉积相关的主效基因.[方法]从2 000只番鸭中随机选取200只70日龄的番鸭进行屠宰,采集腹脂并称重,计算腹脂率.按腹脂率大小排序,选取腹脂率最高的5只和最低的5只番鸭的回肠组织进行转录组测序分析.利用Illumina NovaSeq 6000高通量RNA-Seq测序技术对2种腹脂率番鸭的回肠进行转录组测序,使用RSEM软件将测序得到的reads序列与Trinity拼接的参考基因组进行序列比对,筛选出差异表达基因,利用GO和KEGG数据库进行功能注释、富集分析和聚类分析,并利用皮尔森相关性分析方法分析了腹脂重和腹脂率与差异表达基因的相关性.[结果]高腹脂率和低腹脂率番鸭的回肠差异表达基因共有602个;与低腹脂率番鸭相比,高腹脂率番鸭回肠中有285个基因上调,317个基因下调.GO和KEGG富集分析显示,有5个与脂肪代谢相关的GO条目(脂质应答、类固醇激素介导的信号通路、类固醇激素应答、类固醇激素刺激的细胞应答和脂质的细胞应答)和4个KEGG通路(PPAR信号通路、初级胆汁酸的生物合成、花生四烯酸代谢和胆汁分泌),并筛选出与脂肪代谢显著相关的6个基因(P＜0.05),包括NR5A2、ACBP、ACOX2、FABP2、FABP4和FABP5,其中,A COX2和FA BP5基因与腹脂重和腹脂率呈显著正相关(P＜0.05),ACBP基因与腹脂重和腹脂率呈极显著正相关(P＜0.01).[结论]不同腹脂率番鸭回肠转录组存在差异,发现5个GO条目和4个KEGG通路,NR5A2、ACBP、ACOX2、FABP2、FABP4和FABP5等基因与番鸭腹部脂肪沉积相关.
文献关键词：
番鸭;腹脂;脂肪代谢;转录组
中图分类号：
作者姓名：
王小骊;王兴鑫;杨彩梅;肖英平;杨华;吕文涛
作者机构：
浙江省农业科学院,省部共建农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室,杭州310021;浙江省农业科学院农产品质量安全与营养研究所,杭州310021;浙江农林大学动物科技学院·动物医学院,杭州311300
文献出处：
引用格式：
[1]王小骊;王兴鑫;杨彩梅;肖英平;杨华;吕文涛-.不同腹脂率番鸭回肠转录组差异分析)[J].中国畜牧兽医,2022(08):2899-2909
A类：
ACBP,FABP2
B类：
腹脂率,番鸭,回肠,转录组差异分析,沉积相,主效基因,日龄,屠宰,并称,称重,转录组测序分析,Illumina,NovaSeq,RSEM,reads,Trinity,拼接,参考基因,序列比对,出差,差异表达基因,功能注释,富集分析,皮尔森相关性分析,脂肪代谢,条目,类固醇激素,激素应答,PPAR,初级胆汁酸,生物合成,花生四烯酸代谢,NR5A2,ACOX2,FABP4,FABP5,腹部脂肪,脂肪沉积
AB值：
0.22438
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