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三角褐指藻dxs基因克隆与诱导表达
文献摘要：
为研究6种外源因素处理对三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(DXS)基因表达的影响,通过高通量转录组测序技术获得三角褐指藻dxs基因cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析.研究结果表明,三角褐指藻dxs基因cDNA全长2476 bp,ORF全长2193 bp,编码730个氨基酸,具有高度保守的ThDP结合位点和转酮醇酶结构域.三角褐指藻DXS蛋白为亲水性稳定蛋白,相对分子质量(Mw)为79.31 kD,理论等电点为6.65,具有信号肽、跨膜区域、卷曲螺旋和TM-螺旋等.系统进化树分析结果表明,DXS蛋白进化树分为高等植物和藻类2个分支,高等植物DXS蛋白进一步分为DXS1和DXS2两支,藻类DXS蛋白聚类为3个分支,分别为硅藻门、红藻门和绿藻门分支,三角褐指藻聚类在硅藻门分支上.诱导表达调控结果表明,三角褐指藻dxs基因受到茉莉酸甲酯(MeJA)、花生四烯酸(AA)、硫酸铈铵(ACS)、光合诱导素(PIF)、光合抑制剂(DCMU)和光质等6种外源因素的诱导调控.在100 μmol/LMeJA、62.5 mg/L AA、1.6 mg/L ACS、1.00 μg/L PIF、0.2 mg/L DCMU和紫光处理下,三角褐指藻dxs基因表达量最高.在MeJA和光质处理下,三角褐指藻dxs基因表达量与岩藻黄素含量变化趋势一致,说明DXS是MeJA和光质等诱导子促进三角褐指藻岩藻黄素积累的关键酶之一.研究为进一步利用代谢工程手段提高藻细胞内岩藻黄素含量提供了良好的基因资源,为深入探索三角褐指藻岩藻黄素合成的分子调控机制提供了一定的理论依据.
文献关键词：
1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶;岩藻黄素;生物信息学;表达调控;三角褐指藻
中图分类号：
作者姓名：
舒明雨;龚一富;吕欣梦;贾泽茗;王博;刘瑄瑄;王何瑜
作者机构：
宁波大学海洋学院,浙江省海洋生物工程重点实验室,宁波315832;宁波大学食品与药学学院,宁波315832
文献出处：
引用格式：
[1]舒明雨;龚一富;吕欣梦;贾泽茗;王博;刘瑄瑄;王何瑜-.三角褐指藻dxs基因克隆与诱导表达)[J].水生生物学报,2022(09):1310-1318
A类：
dxs,ThDP,DXS1,DXS2,DCMU,LMeJA
B类：
三角褐指藻,基因克隆,诱导表达,外源因素,素处理,Phaeodactylum,tricornutum,脱氧,合成酶,高通量转录组测序技术,技术获得,cDNA,全长,生物信息学分析,bp,ORF,结合位点,转酮醇酶,酶结构,结构域,亲水性,相对分子质量,Mw,kD,等电点,信号肽,卷曲螺旋,TM,系统进化树分析,高等植物,藻类,两支,硅藻门,红藻门,绿藻,表达调控,茉莉酸甲酯,花生四烯酸,AA,硫酸铈,ACS,光合,PIF,光质,导调,紫光,光处理,基因表达量,岩藻黄素,含量变化,诱导子,关键酶,代谢工程,高藻,基因资源,分子调控机制
AB值：
0.302423
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