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典型文献
METTL14在CML细胞中的表达及其与PKM剪接体间的相关性分析
文献摘要:
目的 探讨METTL14在伊马替尼(Imatinib,IM)敏感和耐药慢粒(chronic myeloid leukemia,CML)细胞中的表达差异,并分析其与PKM剪接体间的相关性.方法 收集南昌大学第二附属医院门诊的健康对照组、CML慢性期、CML急变期各5例外周血或骨髓,运用RNA转录组测序(RNA-seq)技术进行测序,筛选差异表达基因;另收集30例IM敏感的慢性期CML患者外周血或骨髓作为IM敏感组,10例IM耐药急变期标本作为耐药组,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证40例临床样本中METTL14基因差异表达,并采用Spearman法分析METTL14和PKM剪接体的相关性,同时通过SRAMP网址预测PKM基因是否含有m6A修饰位点.结果 RNA测序结果显示,分别与对照组和慢性期比,急变期基因表达谱有很大的差异,且差异基因显著富集的是剪接体功能通路;METTL14 mRNA在IM敏感组和耐药组中相对表达量分别是(13.720±2.512)和(21.450±1.426),差异有统计学意义(P=0.028).qRT-PCR结果显示METTL14 mRNA在敏感组中的表达较耐药组显著降低(P<0.001);Spearman相关分析表明,METTL14 mRNA表达水平与PKM2/PKM1比值呈正相关(r=0.495,P=0.005);SRAMP网址预测PKM基因9号外显子区域高度富集m6A修饰位点.结论 高表达的METTL14介导的m6A修饰PKM基因外显子9使其高度甲基化而不被剪接,PKM1生成减少,PKM2相应增多,从而促进CML耐药,为探讨CML耐药机制和治疗靶点提供新思路.
文献关键词:
METTL14;PKM剪接体;慢性粒细胞白血病;相关性
作者姓名:
廖志华;刘静;李书琪;姚芳苡;黄波;章海斌;张静;王小中
作者机构:
江西省妇幼保健院检验科,江西 南昌 330006;江西省检验医学重点实验室 南昌大学第二附属医院检验科,江西 南昌330006
文献出处:
引用格式:
[1]廖志华;刘静;李书琪;姚芳苡;黄波;章海斌;张静;王小中-.METTL14在CML细胞中的表达及其与PKM剪接体间的相关性分析)[J].实验与检验医学,2022(01):40-43
A类:
Imatinib,SRAMP
B类:
METTL14,CML,剪接体,伊马替尼,IM,chronic,myeloid,leukemia,表达差异,南昌大学,医院门诊,慢性期,急变期,转录组测序,seq,差异表达基因,另收,药组,qRT,临床样本,基因差异表达,网址,m6A,修饰位点,基因表达谱,差异基因,相对表达量,PKM2,PKM1,外显子,子区域,甲基化,耐药机制,治疗靶点,慢性粒细胞白血病
AB值:
0.224374
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