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三代宏基因组测序在食源性疾病事件中的应用
文献摘要:
目的 探索三代宏基因组测序在食源性疾病事件中病原菌快速识别的运用.方法 随机选取1份2021年四川某地食源性疾病事件中的腹泻样本作为研究对象,应用三代宏基因组建库测序,基于测序数据进行快速识别引起食源性疾病的病原体.结果 传统分离鉴定方法经过3d分离鉴定出由肠炎沙门引起的食源性疾病暴发事件,宏基因组测序6h就能快速识别出丰度很高的肠炎沙门菌.结论 三代宏基因组测序技术在处理食源性疾病事件中时效性性及准确性较高,具有一定的可行性.
文献关键词:
三代宏基因组;快速诊断;食源性疾病
中图分类号:
作者姓名:
刘丽;杨小蓉;彭凯;孙欣然;王乐
作者机构:
四川省疾病预防控制中心,成都610041;扬州大学,江苏 扬州225009;绵阳市疾病预防控制中心,四川 绵阳621000
文献出处:
引用格式:
[1]刘丽;杨小蓉;彭凯;孙欣然;王乐-.三代宏基因组测序在食源性疾病事件中的应用)[J].预防医学情报杂志,2022(11):1497-1500
A类:
三代宏基因组
B类:
食源性疾病事件,快速识别,建库,序数,病原体,分离鉴定,鉴定方法,法经,3d,食源性疾病暴发事件,6h,肠炎沙门菌,宏基因组测序技术,中时,快速诊断
AB值:
0.128074
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