典型文献
宏基因组测序技术在发热患者咽部微生物菌群研究中的应用
文献摘要：
目的 通过宏基因组高通量测序分析,研究不同发热患者咽部微生物菌群多样性.方法 采用随机法选取2020年1-4月石家庄市五所医院发热门诊就诊21例发热患者作为实验组,选取同期10例健康人作为对照组,采集咽拭子样本并提取核酸,应用Illumina测序平台进行宏基因组测序并进行微生物菌群分析.结果 实验组共获得1 716 802 816条优质序列,鉴定出4079个物种,归属于97个门,951个属.实验组和对照组咽部微生物菌群分析显示,在门水平上,梭杆菌门和厚壁菌门在对照组中升高,拟杆菌门在实验组中升高;在纲水平上,梭杆菌纲和梭菌纲在对照组中升高,拟杆菌纲在实验组中升高;在目水平上,拟杆菌目在实验组中升高;在科水平上,瘤胃菌科在对照组中升高,拟杆菌科、理研菌科、阿克曼氏菌科、红细菌科和火色杆菌科在实验组中升高;在属水平上,拟普雷沃菌属、拟杆菌属、理研菌属、副拟杆菌属等在实验组中升高,瘤胃球菌属在对照组中升高;在种水平上,紫单胞菌科细菌(Porphyromona-daceae bacterium KA00676)、两个拟杆菌属(Bcteroidales bacterium Barb7,Bcteroidales SP.CAG:702)、五个普雷沃氏菌(CAG:617、CAG:755、CAG:732、CAG:924、CAG:1031)、卟啉单胞菌KLE1280、甲烷囊菌属的PtaU1.Bin060等在实验组中升高.实验组差异物种有消化链球菌、拟杆菌、科马加泰杆菌、明串珠菌、支原体、假棒状杆菌等.耐药基因主要为β-内酰胺酶类.结论 发热患者咽部有复杂的微生物菌群结构,本研究表明咽部菌群结构会对机体发热有显著影响.
文献关键词：
宏基因组测序;发热;微生物菌群
中图分类号：
作者姓名：
郭玉梅;张玉兰;蒋瑞萍;秦丽云;高伟利;李俊平
作者机构：
石家庄市疾病预防控制中心,河北石家庄050011;河北省疑难细菌研究重点实验室,河北石家庄050011;石家庄市第二医院,河北石家庄050000
文献出处：
引用格式：
[1]郭玉梅;张玉兰;蒋瑞萍;秦丽云;高伟利;李俊平-.宏基因组测序技术在发热患者咽部微生物菌群研究中的应用)[J].中国热带医学,2022(07):678-684
A类：
Porphyromona,KA00676,Bcteroidales,Barb7,KLE1280,PtaU1,Bin060
B类：
宏基因组测序技术,发热患者,宏基因组高通量测序,高通量测序分析,微生物菌群多样性,石家庄市,五所,医院发热门诊,门诊就诊,健康人,咽拭子,子样本,Illumina,测序平台,菌群分析,共获,归属于,梭杆菌,和厚壁,厚壁菌门,拟杆菌门,梭菌,瘤胃,阿克曼氏菌,火色,普雷沃菌属,拟杆菌属,daceae,bacterium,SP,CAG,普雷沃氏菌,卟啉单胞菌,异物,链球菌,明串珠菌,支原体,棒状杆菌,耐药基因,内酰胺酶,酶类,微生物菌群结构,咽部菌群
AB值：
0.257941
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