典型文献
3种含笑属植物叶绿体基因组密码子偏好性分析
文献摘要：
明确3种含笑属植物叶绿体基因组密码子的使用偏性及影响其偏性的因素.利用CodonW1.4.2、Genious 8.1.3、CUSP等软件对3个含笑属植物叶绿体基因组密码子的使用模式偏好性进行了分析.3种含笑属植物叶绿体基因组的GC含量在38.9％～39.3％之间;ENC值为在36.22～57.91之间,表明其密码子偏好性较弱.中性绘图、ENC-plot、PR2-plot分析表明影响3种含笑属植物叶绿体基因组密码子使用偏性的主要因素是自然选择.在此基础上,利用RSCU和ENC值筛选出3种含笑属植物叶绿体基因组的最优密码子共30个,其中29个以A/U结尾,UAU、CAU、CAA、AAU、AAA、GGA为3种含笑属植物共有的最优密码子.3种含笑属植物密码子偏好使用A/T结尾,其密码子使用偏性主要受到自然选择的影响.本研究对3种含笑属植物叶绿体基因组密码子的使用偏性进行分析,揭示影响其密码子使用偏性的主要因素,为后续3种含笑属叶绿体基因组外源蛋白表达载体的构建及优化等方面的研究提供了理论依据.
文献关键词：
含笑属;叶绿体基因组;密码子偏好性;最优密码子
中图分类号：
作者姓名：
周涛;杨林;舒军霞;沈莲文;夏晞;王大玮
作者机构：
西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,云南 昆明650224;西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室,云南 昆明650224
文献出处：
引用格式：
[1]周涛;杨林;舒军霞;沈莲文;夏晞;王大玮-.3种含笑属植物叶绿体基因组密码子偏好性分析)[J].西部林业科学,2022(03):91-100
A类：
Genious
B类：
含笑属,植物叶,叶绿体基因组,密码子偏好性,偏好性分析,CodonW1,CUSP,使用模式,ENC,绘图,plot,PR2,密码子使用偏性,自然选择,RSCU,最优密码子,结尾,UAU,CAU,CAA,AAU,AAA,GGA,好使,外源蛋白,表达载体
AB值：
0.190412
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