典型文献
药用真菌茯苓基因组密码子使用偏性分析
文献摘要：
为了解药用真菌茯苓基因组密码子使用模式,探讨影响其密码子组成和编码特性的因素,以茯苓核基因组和线粒体基因组数据为研究对象,利用CodonW、Mega X和EMBOSS等软件对基因密码子使用偏性进行分析,根据中性绘图、奇偶偏性绘图、ENC-plot和对应性分析推测茯苓基因组密码子偏性形成的影响因素.茯苓核基因平均GC含量为57.28％,同义密码子第3位偏好G/C碱基;茯苓核基因密码子偏性主要受选择作用影响,而线粒体基因除了受选择作用影响,还受到较强的碱基突变影响;茯苓核基因部分同义密码子间RSCU值差异较大,高频密码子和最优密码子均以G/C结尾.茯苓核基因密码子偏性较强,进化过程中受到较强的环境和寄主选择作用.与酵母相比,大肠杆菌基因密码子使用模式更接近于茯苓,大肠杆菌可能更适合作为茯苓基因异源表达宿主.上述结果可为茯苓的分子进化及外源基因的转基因研究提供参考.
文献关键词：
茯苓;密码子使用偏性;最优密码子;选择压力;线粒体
中图分类号：
作者姓名：
韩利红;贾欣楠;陈仁欢;刘潮
作者机构：
曲靖师范学院生物资源与食品工程学院,云南省高校特色果酒技术创新与应用工程研究中心,云南曲靖655011
文献出处：
引用格式：
[1]韩利红;贾欣楠;陈仁欢;刘潮-.药用真菌茯苓基因组密码子使用偏性分析)[J].中国农业科技导报,2022(01):83-90
A类：
B类：
药用真菌,茯苓,密码子使用偏性,解药,使用模式,密码子组,核基因组,线粒体基因组,基因组数据,CodonW,Mega,EMBOSS,绘图,奇偶,ENC,plot,对应性,密码子偏性,同义密码子,选择作用,作用影响,碱基突变,变影,RSCU,高频密码子,最优密码子,结尾,寄主选择,酵母,大肠杆菌,异源表达,宿主,分子进化,外源基因,转基因,基因研究,选择压力
AB值：
0.329914
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
