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橄榄叶绿体基因组密码子偏好性特征
文献摘要：
利用CodonW程序和EMBOSS在线软件对橄榄叶绿体基因组进行密码子偏好性分析,并研究其密码子偏好性形成的影响因素.结果表明,橄榄叶绿体基因组有效密码子数(ENc)、密码子GC含量(GC)和密码子第3位上的GC含量(GC3s)分别为50.36、0.385和0.305,CGT、CCT和GGT等可作为橄榄叶绿体基因的最优密码子.中性绘图分析、ENc对应分析、偏倚分析和同义密码子相对使用度对应性分析发现,橄榄叶绿体基因组密码子偏好性不是单一因素影响的结果.橄榄叶绿体基因组密码子偏好性较弱,整体上偏好使用A和T,这种偏好性可能受突变压力、自然选择和其他因素的共同作用.
文献关键词：
橄榄;叶绿体;基因组;密码子偏好性;进化
中图分类号：
作者姓名：
赖瑞联;陈瑾;冯新;覃振师;陈义挺;沈朝贵;田奇琳;吴如健
作者机构：
福建省农业科学院果树研究所,福建 福州350013;广西农业科学院广西南亚热带农业科学研究所,广西 崇左532415;闽南师范大学生物科学与技术学院,福建 漳州363000
文献出处：
引用格式：
[1]赖瑞联;陈瑾;冯新;覃振师;陈义挺;沈朝贵;田奇琳;吴如健-.橄榄叶绿体基因组密码子偏好性特征)[J].福建农林大学学报（自然科学版）,2022(04):502-509
A类：
B类：
橄榄,叶绿体基因组,密码子偏好性,CodonW,EMBOSS,偏好性分析,有效密码子数,ENc,GC3s,CGT,CCT,GGT,最优密码子,绘图,对应分析,偏倚分析,同义密码子,用度,对应性,好使,突变压力,自然选择
AB值：
0.223212
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