典型文献
建始槭叶绿体基因组密码子使用偏性分析
文献摘要:
利用CodonW1.4.2和CUSP在线程序,系统分析了50条建始槭叶绿体基因密码子的使用模式及其成因.结果表明:建始槭叶绿体基因组密码子的碱基组成呈GC31的密码子有30个,除UUG外,其余都以A、U结尾,以上说明其密码子使用偏性不强,且偏爱以A、U结尾.中性绘图分析显示,GC12和GC3相关系数为0.0132,相关性不显著;ENC-plot分析显示有64%的基因分布在-0.05~0.05区间外;PR2-plot分析显示碱基在密码子上的使用频率呈C>G、T>A的分布趋势;筛选出最优密码子16个.综上所述,建始槭叶绿体基因组密码子使用偏性主要受自然选择的影响.
文献关键词:
建始槭;叶绿体基因组;密码子偏好性;最优密码子
中图分类号:
作者姓名:
赵月梅;杨贵清;徐其碧;尹鑫;徐林;丁波
作者机构:
贵州师范学院生物科学学院,贵州 贵阳550018
文献出处:
引用格式:
[1]赵月梅;杨贵清;徐其碧;尹鑫;徐林;丁波-.建始槭叶绿体基因组密码子使用偏性分析)[J].福建农林大学学报(自然科学版),2022(06):792-799
A类:
建始槭
B类:
叶绿体基因组,密码子使用偏性,CodonW1,CUSP,在线程序,使用模式,碱基组成,GC3,GC2,偏爱,结尾,有效密码子数,ENC,同义密码子,使用频率,RSCU,UUG,绘图,GC12,plot,基因分布,PR2,最优密码子,综上所述,自然选择,密码子偏好性
AB值:
0.260885
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