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典型文献
青海省格尔木牦牛的母系遗传多样性及支系组成
文献摘要:
[目的]从分子水平上探究青海省格尔木牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构及其遗传背景.[方法]对49头格尔木牦牛mtDNA D-loop区部分序列进行了测定,后使用DnaSP 5.10.01、Arlequin 3.11和MEGA 5.05等生物信息学软件确定其多态位点和单倍型数目,计算核苷酸多样度和单倍型多样度大小,并进行系统发育分析.[结果]在截取的618 bp格尔木牦牛D-loop区分析序列中,排除1处插入(缺失)后共检测到45处多态位点,包括10处单一多态位点和35处简约信息位点;根据序列间核苷酸变异共确定了18种单倍型,其中单倍型H4为优势单倍型,核苷酸多样度为0.015±0.008,单倍型多样度为0.911±0.022.与野牦牛及大通、天祝、金川等其他家牦牛品种相比,格尔木牦牛群体单倍型多样度和核苷酸多样度值均较高,表明该群体具有丰富的母系遗传多样性.以美洲野牛为外群,邻接法(即NJ法)构建的系统发育树结果显示:格尔木牦牛群体18种单倍型分布在A、B、C、D和G5种单倍型组中,且聚为3个大的分支,提示格尔木牦牛由3个母系支系组成,拥有3个母系起源.[结论]格尔木牦牛群体具有丰富的母系遗传多样性,由3个母系支系组成,推测其有3个母系起源.
文献关键词:
格尔木牦牛;mtDNA;D-loop区;母系遗传多样性;支系组成
作者姓名:
白诗睿;马志杰;李广祯;杨振菲;陈生梅;谢银禄;郭东风;陈立
作者机构:
青海大学畜牧兽医科学院,青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室,西宁810016;青海省格尔木市畜牧兽医站,青海格尔木816000;青海省格尔木市唐古拉山镇兽医站,青海格尔木816099
文献出处:
引用格式:
[1]白诗睿;马志杰;李广祯;杨振菲;陈生梅;谢银禄;郭东风;陈立-.青海省格尔木牦牛的母系遗传多样性及支系组成)[J].中国牛业科学,2022(02):33-38
A类:
格尔木牦牛
B类:
青海省,母系遗传多样性,支系组成,分子水平,群体遗传结构,遗传背景,mtDNA,loop,DnaSP,Arlequin,MEGA,生物信息学软件,多态位点,单倍型,系统发育分析,截取,bp,一多,简约,H4,野牦牛,大通,天祝,金川,他家,牛群,美洲,野牛,邻接,接法,NJ,系统发育树,G5,母系起源
AB值:
0.241828
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