典型文献
云南中甸地区3个牛种PRNP基因23 bp和12 bp位点的InDel多态性与表达水平
文献摘要:
为了探讨云南中甸地区3个地方牛种(中甸牦牛、中甸犏牛、中甸黄牛)朊蛋白基因(PRNP)启动子区和第1内含子区2个位点(23 bp和12 bp)的插入/缺失突变与PRNP基因mRNA表达的相关性,采用聚合酶链式反应、琼脂糖电泳及测序等方法对3个牛种的PRNP基因23 bp和12 bp位点进行基因分型,比较各组间2个位点的等位基因及基因型分布是否存在差异,并进一步采用荧光定量PCR检测延髓组织内PRNP基因表达水平,分析基因型与基因表达水平的关系.结果表明:中甸牦牛的23 bp InDel缺失纯合(-/-)基因型频率最高(0.838),插入等位基因频率极低(0.09),中甸犏牛(0.467)和中甸黄牛(0.399)的缺失纯合基因型频率也较高;而在12 bp InDel中,3种牛的插入纯合(+/+)基因型频率很高,缺失等位基因频率较低;中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23-12+为主,频率为0.794和0.444,而中甸黄牛主单倍型为23+12-,频率为0.434.性别、年龄和毛色对3种牛延髓组织中PRNP基因的mRNA表达量无显著影响(P>0.05);3种牛23 bp和12 bp的不同基因型和单倍型之间的mRNA表达量差异均不显著(P>0.05),可能与不同基因型mRNA表达量测定时获得的样品量差异太大有关.研究揭示,23 bp InDel缺失等位基因频率和基因型频率在3种牛中都是最高的,而在12 bp InDel中,缺失等位基因频率和基因型频率均较低,对比以往认为的BSE抗病单倍型23+12+,中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23-12+为主,中甸黄牛以23+12-为主,可通过育种改良筛选,培育对BSE有较高抗病性的群体.
文献关键词:
中甸;PRNP;朊病毒;插入缺失
中图分类号:
作者姓名:
和晓明;Sameeullah MEMON;刘兴能;岳丹;邓卫东;席冬梅
作者机构:
云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;云南农业职业技术学院,云南昆明650031
文献出处:
引用格式:
[1]和晓明;Sameeullah MEMON;刘兴能;岳丹;邓卫东;席冬梅-.云南中甸地区3个牛种PRNP基因23 bp和12 bp位点的InDel多态性与表达水平)[J].家畜生态学报,2022(08):13-19
A类:
23+12,23+12+
B类:
南中,PRNP,bp,InDel,多态性,地方牛,中甸牦牛,犏牛,黄牛,朊蛋白基因,启动子区,内含子,个位,缺失突变,聚合酶链式反应,琼脂糖,电泳,基因分型,基因型分布,延髓,基因表达水平,基因型频率,等位基因频率,种牛,单倍型,毛色,不同基因型,样品量,太大,BSE,育种改良,高抗,抗病性,朊病毒,插入缺失
AB值:
0.206994
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